RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERBB4Q15303 1308 aa20.35■□□□□ 0.85
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.35■□□□□ 0.85
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.25■□□□□ 0.83
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.25■□□□□ 0.83
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.23■□□□□ 0.83
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C21orf2O43822 256 aa20.21■□□□□ 0.83
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC27Q2M243 656 aa20.21■□□□□ 0.83
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLX4Q8IY92 1834 aa20.2■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NPR1P16066 1061 aa20.2■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERFEQ4G0M1 354 aa20.2■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.19■□□□□ 0.82
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NTSR2O95665 410 aa20.19■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRELPP51888 382 aa20.19■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C1QTNF8P60827 252 aa20.19■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PARP10Q53GL7 1025 aa20.19■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WWC1Q8IX03 1113 aa20.19■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.18■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LMNB1P20700 586 aa20.17■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.17■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.17■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HYPKQ9NX55 129 aa20.17■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.17■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.17■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CRY2Q49AN0 593 aa20.16■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TCIRG1Q13488 830 aa20.15■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.15■□□□□ 0.82
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
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