RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449039.5

LRRC23-210, Transcript of leucine rich repeat containing 23, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC23, Length 729 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23-210ENST00000449039 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.9■■□□□ 1.9
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LRRC23-210ENST00000449039 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.89■■□□□ 1.9
LRRC23-210ENST00000449039 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.9
LRRC23-210ENST00000449039 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.88■■□□□ 1.89
LRRC23-210ENST00000449039 NGEFQ8N5V2 710 aa26.88■■□□□ 1.89
LRRC23-210ENST00000449039 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
LRRC23-210ENST00000449039 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.86■■□□□ 1.89
LRRC23-210ENST00000449039 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.85■■□□□ 1.89
LRRC23-210ENST00000449039 MYL6BP14649 208 aa26.85■■□□□ 1.89
LRRC23-210ENST00000449039 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.85■■□□□ 1.89
LRRC23-210ENST00000449039 RNF181Q9P0P0 153 aa26.85■■□□□ 1.89
LRRC23-210ENST00000449039 ERBB4Q15303 1308 aa26.85■■□□□ 1.89
LRRC23-210ENST00000449039 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.84■■□□□ 1.89
LRRC23-210ENST00000449039 HLFQ16534 295 aa26.84■■□□□ 1.89
LRRC23-210ENST00000449039 CNKSR1Q969H4 720 aa26.83■■□□□ 1.89
LRRC23-210ENST00000449039 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.83■■□□□ 1.89
LRRC23-210ENST00000449039 SBF1O95248 1867 aa26.83■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 STYK1Q6J9G0 422 aa26.82■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 MASTLQ96GX5 879 aa26.82■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.82■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 SRGNP10124 158 aa26.81■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 FAM177BA6PVY3 158 aa26.8■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 LMNB1P20700 586 aa26.8■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.8■■□□□ 1.88
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LRRC23-210ENST00000449039 KIF3CO14782 793 aa26.79■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 RASSF7Q02833 373 aa26.79■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 NUP98P52948 1817 aa26.79■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 C21orf2O43822 256 aa26.78■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 NYXQ9GZU5 481 aa26.78■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.77■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.77■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
LRRC23-210ENST00000449039 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 NPR1P16066 1061 aa26.75■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 SOGA3Q5TF21 947 aa26.75■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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LRRC23-210ENST00000449039 PDIA6Q15084 440 aa26.74■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.74■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.72■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 SLX4Q8IY92 1834 aa26.72■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 APAF1O14727 1248 aa26.72■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 GPTP24298 496 aa26.72■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.72■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 NECTIN2Q92692 538 aa26.72■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 CFAP44Q96MT7 982 aa26.72■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
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LRRC23-210ENST00000449039 PROSER3Q2NL68 480 aa26.71■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.71■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 CACNA1SQ13698 1873 aa26.7■■□□□ 1.87
LRRC23-210ENST00000449039 TOMM70O94826 608 aa26.7■■□□□ 1.86
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LRRC23-210ENST00000449039 ALDH1B1P30837 517 aa26.69■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 KRT24Q2M2I5 525 aa26.69■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.69■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.69■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.69■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.69■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
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LRRC23-210ENST00000449039 ERFEQ4G0M1 354 aa26.68■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 PARP10Q53GL7 1025 aa26.68■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 SUSD4Q5VX71 490 aa26.68■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 COPS6Q7L5N1 327 aa26.68■■□□□ 1.86
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LRRC23-210ENST00000449039 GLTPD2A6NH11 291 aa26.66■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 HSPA6P17066 643 aa26.66■■□□□ 1.86
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LRRC23-210ENST00000449039 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.66■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.65■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 MBIPQ9NS73 344 aa26.65■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 IFT57Q9NWB7 429 aa26.65■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 ABCC12Q96J65 1359 aa26.64■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 ZNF853P0CG23 659 aa26.64■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 GNAI1P63096 354 aa26.64■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 CRY2Q49AN0 593 aa26.64■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.64■■□□□ 1.86
LRRC23-210ENST00000449039 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
LRRC23-210ENST00000449039 ANP32CO43423 234 aa26.63■■□□□ 1.85
LRRC23-210ENST00000449039 NTSR2O95665 410 aa26.63■■□□□ 1.85
LRRC23-210ENST00000449039 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.63■■□□□ 1.85
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