RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

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Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 WDR63Q8IWG1 891 aa4.53□□□□□ -1.68
SNORD17-201ENST00000390930 KLHL34Q8N239 644 aa4.53□□□□□ -1.68
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC24Q8N4L8 307 aa4.53□□□□□ -1.68
SNORD17-201ENST00000390930 CHPF2Q9P2E5 772 aa4.53□□□□□ -1.68
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
SNORD17-201ENST00000390930 CD2APQ9Y5K6 639 aa4.53□□□□□ -1.68
SNORD17-201ENST00000390930 PXDNLA1KZ92 1463 aa4.53□□□□□ -1.68
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SNORD17-201ENST00000390930 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa4.51□□□□□ -1.69
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SNORD17-201ENST00000390930 C3orf67Q6ZVT6 689 aa4.51□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 G2E3Q7L622 706 aa4.51□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF34Q8IZ26 560 aa4.51□□□□□ -1.69
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SNORD17-201ENST00000390930 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa4.51□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 TAF1P21675 1872 aa4.5□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 CACNA1SQ13698 1873 aa4.5□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 ATP10DQ9P241 1426 aa4.5□□□□□ -1.69
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SNORD17-201ENST00000390930 SYNE4Q8N205 404 aa4.5□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF428Q96B54 188 aa4.5□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 SETDB2Q96T68 719 aa4.5□□□□□ -1.69
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SNORD17-201ENST00000390930 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69not detected■■□□□ 13.3
SNORD17-201ENST00000390930 ABCC12Q96J65 1359 aa4.5□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 LAMB2P55268 1798 aa4.5□□□□□ -1.69
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SNORD17-201ENST00000390930 COL4A1P02462 1669 aa4.49□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa4.49□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 NTSR2O95665 410 aa4.49□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 PRELPP51888 382 aa4.49□□□□□ -1.69
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SNORD17-201ENST00000390930 ZNF652Q9Y2D9 606 aa4.49□□□□□ -1.69
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SNORD17-201ENST00000390930 SLC10A5Q5PT55 438 aa4.48□□□□□ -1.69
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SNORD17-201ENST00000390930 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 CNBD1Q8NA66 436 aa4.48□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 PLBD2Q8NHP8 589 aa4.48□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 C7orf43Q8WVR3 580 aa4.48□□□□□ -1.69
SNORD17-201ENST00000390930 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
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