RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.47■■□□□ 1.19
USP11-202ENST00000377078 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.46■■□□□ 1.19
USP11-202ENST00000377078 ERBB4Q15303 1308 aa22.46■■□□□ 1.19
USP11-202ENST00000377078 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
USP11-202ENST00000377078 NGEFQ8N5V2 710 aa22.44■■□□□ 1.18
USP11-202ENST00000377078 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
USP11-202ENST00000377078 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.43■■□□□ 1.18
USP11-202ENST00000377078 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.43■■□□□ 1.18
USP11-202ENST00000377078 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.43■■□□□ 1.18
USP11-202ENST00000377078 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.42■■□□□ 1.18
USP11-202ENST00000377078 MYL6BP14649 208 aa22.42■■□□□ 1.18
USP11-202ENST00000377078 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.42■■□□□ 1.18
USP11-202ENST00000377078 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
USP11-202ENST00000377078 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
USP11-202ENST00000377078 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.4■■□□□ 1.18
USP11-202ENST00000377078 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
USP11-202ENST00000377078 CNKSR1Q969H4 720 aa22.4■■□□□ 1.18
USP11-202ENST00000377078 RNF181Q9P0P0 153 aa22.4■■□□□ 1.18
USP11-202ENST00000377078 HLFQ16534 295 aa22.39■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 STYK1Q6J9G0 422 aa22.39■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 NYXQ9GZU5 481 aa22.39■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.39■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 CHL1O00533 1208 aa22.38■■□□□ 1.17
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USP11-202ENST00000377078 MASTLQ96GX5 879 aa22.38■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.38■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 FAM177BA6PVY3 158 aa22.37■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.36■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 SRGNP10124 158 aa22.36■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 LMNB1P20700 586 aa22.36■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 SOGA3Q5TF21 947 aa22.36■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.36■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.36■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.35■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 NPR1P16066 1061 aa22.35■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 RASSF7Q02833 373 aa22.35■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 APAF1O14727 1248 aa22.34■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 CFAP44Q96MT7 982 aa22.34■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 ANP32CO43423 234 aa22.33■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 C21orf2O43822 256 aa22.33■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 HOXB7P09629 217 aa22.33■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
USP11-202ENST00000377078 GPTP24298 496 aa22.32■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 NECTIN2Q92692 538 aa22.31■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 NUP98P52948 1817 aa22.3■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 KIF3CO14782 793 aa22.3■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 PDIA6Q15084 440 aa22.3■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 PARP10Q53GL7 1025 aa22.3■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.3■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.3■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.3■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
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USP11-202ENST00000377078 ALDH1B1P30837 517 aa22.29■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 GNAI1P63096 354 aa22.29■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.29■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 IFT57Q9NWB7 429 aa22.29■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 ANXA1P04083 346 aa22.28■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 PROSER3Q2NL68 480 aa22.28■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.28■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.28■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.28■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 TOMM70O94826 608 aa22.27■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 KRT24Q2M2I5 525 aa22.27■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 COPS6Q7L5N1 327 aa22.27■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.27■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.27■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 MBIPQ9NS73 344 aa22.27■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.27■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.27■■□□□ 1.16
USP11-202ENST00000377078 ERFEQ4G0M1 354 aa22.26■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 CCDC93Q567U6 631 aa22.26■■□□□ 1.15
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USP11-202ENST00000377078 MRS2Q9HD23 443 aa22.26■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.26■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.25■■□□□ 1.15
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USP11-202ENST00000377078 SUSD4Q5VX71 490 aa22.25■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.25■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 ABCC12Q96J65 1359 aa22.25■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 SLX4Q8IY92 1834 aa22.24■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 CRY2Q49AN0 593 aa22.24■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.24■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.24■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 CACNA1SQ13698 1873 aa22.24■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 NTSR2O95665 410 aa22.23■■□□□ 1.15
USP11-202ENST00000377078 ZNF853P0CG23 659 aa22.23■■□□□ 1.15
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