RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 DESP17661 470 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 SPA17Q15506 151 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 CNNM3Q8NE01 707 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 SNRKQ9NRH2 765 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 NLRP5P59047 1200 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 NEK1Q96PY6 1258 aa23.52■■□□□ 1.36
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.52■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.52■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 TSG101Q99816 390 aa23.52■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 FSIP1Q8NA03 581 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 KIF20AO95235 890 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC96Q2M329 555 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 TNRQ92752 1358 aa23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 GJB2P29033 226 aa23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 POTEJP0CG39 1038 aa23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.354e-9■■■■■ 32.8
CCSAP-203ENST00000366687 CENPHQ9H3R5 247 aa23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 ANXA1P04083 346 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 KIF18AQ8NI77 898 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 GBP3Q9H0R5 595 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 KIF5BP33176 963 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 NUCB1Q02818 461 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 MEIS3Q99687 375 aa23.49■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0754O94854 1291 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 CETN2P41208 172 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 VPS36Q86VN1 386 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 NCOA7Q8NI08 942 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 C6orf229H3BNL8 230 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 BAG3O95817 575 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 CUL5Q93034 780 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 KIF5CO60282 957 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 FBLN1P23142 703 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH1L1O75891 902 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 PDE4BQ07343 736 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 CHRNA2Q15822 529 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 CAVIN2O95810 425 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 USP25Q9UHP3 1055 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 NEMFO60524 1076 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 NUP160Q12769 1436 aa23.45■■□□□ 1.35
CCSAP-203ENST00000366687 MICU3Q86XE3 530 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 SDSP20132 328 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 HAND2P61296 217 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 TAX1BP1Q86VP1 789 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 TSPY2A6NKD2 308 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC102AQ96A19 550 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 PLCH2O75038 1416 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 PDE1AP54750 535 aa23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2HP62256 183 aa23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 MCM5P33992 734 aa23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 CRACR2AQ9BSW2 395 aa23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 FAM193AP78312 1265 aa23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD62A6NC57 917 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 SSR1P43307 286 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 GSDMDP57764 484 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF165P49910 485 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 STX1AQ16623 288 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 COPS6Q7L5N1 327 aa23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms