RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 ECHDC1Q9NTX5 307 aa27.9■■■□□ 2.06
GNPTAB-201ENST00000299314 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.9■■■□□ 2.06
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GNPTAB-201ENST00000299314 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
GNPTAB-201ENST00000299314 TOP2BQ02880 1626 aa27.9■■■□□ 2.06
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa27.9■■■□□ 2.06
GNPTAB-201ENST00000299314 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.9■■■□□ 2.06
GNPTAB-201ENST00000299314 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
GNPTAB-201ENST00000299314 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
GNPTAB-201ENST00000299314 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
GNPTAB-201ENST00000299314 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
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GNPTAB-201ENST00000299314 NCOA1Q15788 1441 aa27.88■■■□□ 2.05
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GNPTAB-201ENST00000299314 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
GNPTAB-201ENST00000299314 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
GNPTAB-201ENST00000299314 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF20AO95235 890 aa27.87■■■□□ 2.05
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GNPTAB-201ENST00000299314 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.87■■■□□ 2.05
GNPTAB-201ENST00000299314 HYPKQ9NX55 129 aa27.87■■■□□ 2.05
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GNPTAB-201ENST00000299314 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
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GNPTAB-201ENST00000299314 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
GNPTAB-201ENST00000299314 CATIPQ7Z7H3 387 aa27.86■■■□□ 2.05
GNPTAB-201ENST00000299314 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
GNPTAB-201ENST00000299314 ISM2Q6H9L7 571 aa27.86■■■□□ 2.05
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GNPTAB-201ENST00000299314 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
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GNPTAB-201ENST00000299314 NEK1Q96PY6 1258 aa27.85■■■□□ 2.05
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
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GNPTAB-201ENST00000299314 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.85■■■□□ 2.05
GNPTAB-201ENST00000299314 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
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GNPTAB-201ENST00000299314 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
GNPTAB-201ENST00000299314 TSHZ3Q63HK5 1081 aa27.85■■■□□ 2.05
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GNPTAB-201ENST00000299314 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
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GNPTAB-201ENST00000299314 RAPGEF3O95398 923 aa27.84■■■□□ 2.05
GNPTAB-201ENST00000299314 ANAPC15P60006 121 aa27.84■■■□□ 2.05
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GNPTAB-201ENST00000299314 HMG20BQ9P0W2 317 aa27.83■■■□□ 2.05
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GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC175P0C221 793 aa27.83■■■□□ 2.05
GNPTAB-201ENST00000299314 TMOD2Q9NZR1 351 aa27.83■■■□□ 2.05
GNPTAB-201ENST00000299314 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.82■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 KANK3Q6NY19 840 aa27.82■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 TMCO5BA8MYB1 307 aa27.82■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM114A1Q8IWE2 563 aa27.82■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 UBE4AQ14139 1066 aa27.82■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC96Q2M329 555 aa27.82■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 TAOK3Q9H2K8 898 aa27.82■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM67Q5HYA8 995 aa27.82■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC102BQ68D86 513 aa27.82■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa27.82■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 AMPD3Q01432 767 aa27.81■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
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GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.81■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 MAATS1Q7Z4T9 603 aa27.81■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC40Q4G0X9 1142 aa27.81■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 CALML4Q96GE6 196 aa27.81■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa27.81■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 MBIPQ9NS73 344 aa27.81■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 JADE2Q9NQC1 790 aa27.8■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.04
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GNPTAB-201ENST00000299314 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 LIG1P18858 919 aa27.79■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 CUL5Q93034 780 aa27.79■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa27.79■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 CNPY2Q9Y2B0 182 aa27.79■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 IFT140Q96RY7 1462 aa27.79■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.78■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.78■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 HOOK3Q86VS8 718 aa27.78■■■□□ 2.04
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