RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297163.3

SMAD5-AS1-201, SMAD5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD5-AS1, Length 1,816 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CASZ1Q86V15 1759 aa10.02□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 AK7Q96M32 723 aa10.02□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa10.02□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TJP1Q07157 1748 aa10.01□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CCER2I3L3R5 266 aa10.01□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CRKLP46109 303 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SMIM5Q71RC9 77 aa10.01□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FAM9BQ8IZU0 186 aa10.01□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FMNL2Q96PY5 1086 aa10.01□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa10.01□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GNPATO15228 680 aa10□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FANCIQ9NVI1 1328 aa10□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 QSER1Q2KHR3 1735 aa10□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZBTB7AO95365 584 aa10□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SSFA2P28290 1259 aa10□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MIER1Q8N108 512 aa10□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 UBR3Q6ZT12 1888 aa10□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RPS6KA4O75676 772 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CCDC27Q2M243 656 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MTFR1LQ9H019 292 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CHL1O00533 1208 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PHF14O94880 888 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TSPYL4Q9UJ04 414 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 USP16Q9Y5T5 823 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 STARD3NLO95772 234 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 WWC1Q8IX03 1113 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CFAP44Q96MT7 982 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPON1Q9HCB6 807 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZNF853P0CG23 659 aa9.97□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.97□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.97□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LRP5O75197 1615 aa9.97□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 UTRNP46939 3433 aa9.96□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.96□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IFNL1Q8IU54 200 aa9.96□□□□□ -0.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 A1BGP04217 495 aa9.96□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MBIPQ9NS73 344 aa9.96□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IFT57Q9NWB7 429 aa9.96□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HCSTQ9UBK5 93 aa9.96□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EIF5P55010 431 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NBPF26B4DH59 902 aa9.94□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RFC4P35249 363 aa9.94□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRT24Q2M2I5 525 aa9.94□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MSL1Q68DK7 614 aa9.94□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RASEFQ8IZ41 740 aa9.94□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NBPF15Q8N660 670 aa9.94□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 COL15A1P39059 1388 aa9.94□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.94□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GYS1P13807 737 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GNAI1P63096 354 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NGEFQ8N5V2 710 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZNF521Q96K83 1311 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 WDR63Q8IWG1 891 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 C4AP0C0L4 1744 aa9.92□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IL16Q14005 1332 aa9.92□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NARFQ9UHQ1 456 aa9.92□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 POLD1P28340 1107 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FKBP8Q14318 412 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PDIA6Q15084 440 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LRP10Q7Z4F1 713 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LAMB4A4D0S4 1761 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZPR1O75312 459 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms