RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000075017.4

Vpreb1-201, Transcript of Immunoglobulin iota chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vpreb1, Length 766 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Strip1Q8C079 837 aa21.94■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tmem119Q8R138 280 aa21.94■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Eva1cP58659 440 aa21.93■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa21.93■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gja3Q64448 417 aa21.93■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Znf428Q8C1M2 176 aa21.93■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zscan21Q07231 555 aa21.92■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Morc2aQ69ZX6 1030 aa21.92■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Col4a5Q63ZW6 1691 aa21.91■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rtkn2Q14B46 604 aa21.91■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Foxo3Q9WVH4 672 aa21.91■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Plekhh1Q80TI1 1356 aa21.9■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ssc5dQ8BV57 1371 aa21.9■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dok7Q18PE0 504 aa21.9■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ankle2Q6P1H6 964 aa21.9■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa21.9■■□□□ 1.1
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ttll7A4Q9F0 912 aa21.89■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cct4P80315 539 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Flt1P35969 1333 aa21.88■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Duox1A2AQ92 1551 aa21.88■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gnai1B2RSH2 354 aa21.88■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Susd4Q8BH32 490 aa21.88■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Usp16Q99LG0 825 aa21.88■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gnai3Q9DC51 354 aa21.88■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Atp6v0a2P15920 856 aa21.87■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Usp48Q3V0C5 1052 aa21.87■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa21.87■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ptf1aQ9QX98 324 aa21.86■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mrc1Q61830 1456 aa21.85■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Igfbp6P47880 238 aa21.85■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rbm46P86049 533 aa21.85■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Podxl2Q8CAE9 603 aa21.85■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Map3k9Q3U1V8 1077 aa21.84■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa21.84■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa21.84■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Uspl1Q3ULM6 1089 aa21.83■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa21.83■■□□□ 1.09
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Col5a2Q3U962 1497 aa21.83■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa21.82■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 UtrnE9Q6R7 3430 aa21.82■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 SobpQ0P5V2 864 aa21.82■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cyp2ab1S4R196 498 aa21.82■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Golgb1E9PVZ8 3238 aa21.81■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 WaslQ91YD9 501 aa21.81■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Hspa2P17156 633 aa21.8■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa21.8■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Vil1Q62468 827 aa21.79■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa21.79■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Socs7Q8VHQ2 579 aa21.79■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zfp831A2ADM8 1628 aa21.79■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Disp3A3KFU9 1347 aa21.79■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Hoxd11P23813 323 aa21.78■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dlg5E9Q9R9 1921 aa21.77■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Aknad1E9Q8N6 675 aa21.77■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Csf1rP09581 977 aa21.77■■□□□ 1.08
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Setdb1O88974 1307 aa21.77■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm7347D3YYI9 267 aa21.76■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Speer4aF8VPX6 267 aa21.76■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 VwdeQ6DFV8 926 aa21.76■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Flt4P35917 1363 aa21.74■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Psd3Q2PFD7 1037 aa21.74■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mrs2Q5NCE8 434 aa21.73■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Irf9Q61179 399 aa21.73■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gpr101Q80T62 511 aa21.73■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Atxn3Q9CVD2 355 aa21.73■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa21.73■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Slc4a9E9PUP3 929 aa21.72■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Glis2Q8VDL9 521 aa21.72■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gja10Q9WUS4 505 aa21.72■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa21.72■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cnksr1A2A9K7 700 aa21.71■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Glt1d1A4FUP9 346 aa21.71■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Myd88P22366 296 aa21.71■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Lrch1P62046 709 aa21.71■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Neurod2Q62414 383 aa21.71■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ttc41Q692V3 1318 aa21.71■■□□□ 1.07
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 PnnO35691 725 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Insm1Q63ZV0 521 aa21.7■■□□□ 1.06
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 GptQ8QZR5 496 aa21.7■■□□□ 1.06
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cdca7Q9D0M2 382 aa21.7■■□□□ 1.06
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa21.7■■□□□ 1.06
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dcdc2bF7BCK0 340 aa21.69■■□□□ 1.06
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Eif6O55135 245 aa21.69■■□□□ 1.06
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 CanxP35564 591 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Igflr1Q3U4N7 345 aa21.69■■□□□ 1.06
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cyp7a1Q64505 503 aa21.69■■□□□ 1.06
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 DaglaQ6WQJ1 1044 aa21.69■■□□□ 1.06
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 EappQ5BU09 281 aa21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.9 ms