RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Usp5P56399 858 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ncf1Q09014 390 aa17.71■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa17.71■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Lman1Q9D0F3 517 aa17.71■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Asxl2Q8BZ32 1370 aa17.71■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Phf14Q9D4H9 881 aa17.71■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Lmod1Q8BVA4 595 aa17.71■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Wdr63B2RY71 923 aa17.71■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gbp4Q61107 620 aa17.71■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Otud6bQ8K2H2 294 aa17.71■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ano8Q6PB70 1060 aa17.71■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sdc2P43407 202 aa17.7■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rnf187Q8BFX1 236 aa17.7■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Vps16Q920Q4 839 aa17.7■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stx6Q9JKK1 255 aa17.7■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pde1cQ64338 706 aa17.7■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 TxlnbQ8VBT1 685 aa17.7■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa17.7■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gjc1P28229 396 aa17.7■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Bag4Q8CI61 457 aa17.7■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sil1Q9EPK6 465 aa17.7■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fam184aE9PW83 1143 aa17.7■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tceanc2Q8R2M0 207 aa17.7■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa17.7■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Klhl10Q9D5V2 608 aa17.7■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Map9Q3TRR0 646 aa17.69■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 LyarQ08288 388 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa17.69■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 DymQ8CHY3 669 aa17.69■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ctnnbl1Q9CWL8 563 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atf7Q8R0S1 413 aa17.69■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Letm1Q9Z2I0 738 aa17.69■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pik3c2gO70167 1506 aa17.69■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Api5O35841 504 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slc4a4O88343 1079 aa17.69■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CalcaP70160 136 aa17.68■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hs1bp3Q3TC93 395 aa17.68■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gimap8Q75N62 688 aa17.68■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 MicalclQ9D5U9 680 aa17.68■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Jarid2Q62315 1234 aa17.68■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 GckrQ91X44 587 aa17.68■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 FanclQ9CR14 375 aa17.68■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slc1a4O35874 532 aa17.68■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cnga2Q62398 664 aa17.68■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tmx4Q8C0L0 335 aa17.68■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cnot6lQ8VEG6 555 aa17.68■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tspyl3Q3UYP3 334 aa17.67■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Taf7Q9R1C0 341 aa17.67■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kif21aQ9QXL2 1672 aa17.67■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa17.67■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 ImpactO55091 318 aa17.67■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pknox2Q8BG99 474 aa17.67■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Myl6bQ8CI43 207 aa17.67■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dnajc10Q9DC23 793 aa17.67■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rcan3Q9JKK0 239 aa17.67■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Casp1P29452 402 aa17.67■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tax1bp1Q3UKC1 814 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Spag5Q7TME2 1165 aa17.67■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Znf771Q8BJ90 317 aa17.67■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa17.66■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Eif4a2P10630 407 aa17.66■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kmt5bQ3U8K7 883 aa17.66■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 TxlnaQ6PAM1 554 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa17.66■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ano2Q8CFW1 1002 aa17.66■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Podxl2Q8CAE9 603 aa17.66■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Naip5Q9R016 1403 aa17.66■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dnaaf4Q8R368 420 aa17.66■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krt25Q8VCW2 446 aa17.66■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tmod2Q9JKK7 351 aa17.66■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stat1P42225 749 aa17.65■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa17.65■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 KdrP35918 1367 aa17.65■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 PaskQ8CEE6 1383 aa17.65■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 MthfsQ9D110 203 aa17.65■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Epb41l3Q9WV92 929 aa17.65■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dnm1P39053 867 aa17.65■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 WtapQ9ER69 396 aa17.65■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trappc8E9PWG2 1437 aa17.64■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Terf2O35144 541 aa17.64■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Igbp1bQ9QZ29 343 aa17.64■□□□□ 0.42
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa17.64■□□□□ 0.41
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm156Q58A37 223 aa17.64■□□□□ 0.41
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa17.64■□□□□ 0.41
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 DlatQ8BMF4 642 aa17.64■□□□□ 0.41
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa17.64■□□□□ 0.41
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stx1aO35526 288 aa17.64■□□□□ 0.41
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mctp2Q5RJH2 878 aa17.64■□□□□ 0.41
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ampd3O08739 766 aa17.64■□□□□ 0.41
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ttc12Q8BW49 704 aa17.64■□□□□ 0.41
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 F2rP30558 430 aa17.63■□□□□ 0.41
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ercc3P49135 783 aa17.63■□□□□ 0.41
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Smtnl1Q99LM3 459 aa17.63■□□□□ 0.41
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dapk3O54784 448 aa17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.8 ms