RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295767.9

CHCHD4-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHCHD4, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4-201ENST00000295767 NR5A2O00482 541 aa25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 PCDH17O14917 1159 aa25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 OR10H2O60403 315 aa25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 DCTN3O75935 186 aa25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 KCNK10P57789 538 aa25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 TIGD2Q4W5G0 525 aa25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 KIRREL2Q6UWL6 708 aa25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 SPACA3Q8IXA5 215 aa25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 C7orf57Q8NEG2 295 aa25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 AMDHD1Q96NU7 426 aa25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 DCBLD2Q96PD2 775 aa25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 CCDC106Q9BWC9 280 aa25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 GLIPR2Q9H4G4 154 aa25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ADAP2Q9NPF8 381 aa25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 CAPN7Q9Y6W3 813 aa25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ATP1B1P05026 303 aa25.93■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 IL6P05231 212 aa25.93■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 MPIP34949 423 aa25.93■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 LTB4RQ15722 352 aa25.93■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 RAB43Q86YS6 212 aa25.93■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 VPS33AQ96AX1 596 aa25.93■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 SSUH2Q9Y2M2 353 aa25.93■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 RAXQ9Y2V3 346 aa25.93■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 SCN2BO60939 215 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 MRGPREQ86SM8 312 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 NATD1Q8N6N6 113 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 OR9A2Q8NGT5 310 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 NACC2Q96BF6 587 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 SPDL1Q96EA4 605 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 LRRC37BQ96QE4 947 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 OR52E6Q96RD3 313 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 SLC52A3Q9NQ40 469 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 A0A1W2PRB8 838 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 SLC22A2O15244 555 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 EFSO43281 561 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 CAPN3P20807 821 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 NT5EP21589 574 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ANKRD46Q86W74 232 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 CLECL1Q8IZS7 167 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ADCY4Q8NFM4 1077 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 OR11G2Q8NGC1 345 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 DOK4Q8TEW6 326 aa25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 URB1O60287 2271 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 IGF2RP11717 2491 aa25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 A0A1W2PQ72 361 aa25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 C17orf105B2RV13 164 aa25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 RRP8O43159 456 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 COX6A1P12074 109 aa25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 TNNI3P19429 210 aa25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 MANFP55145 182 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 HSPB3Q12988 150 aa25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 PCOLCEQ15113 449 aa25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 TREML1Q86YW5 311 aa25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ZFP28Q8NHY6 868 aa25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 CCDC154A6NI56 674 aa25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 NKX2-8O15522 239 aa25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 C6orf47O95873 294 aa25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 GALNSP34059 522 aa25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 VPS26BQ4G0F5 336 aa25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ANXA8L1Q5VT79 327 aa25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 PROSER1Q86XN7 944 aa25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 RIT1Q92963 219 aa25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 LPAR4Q99677 370 aa25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ZNF700Q9H0M5 742 aa25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 CXorf21Q9HAI6 301 aa25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 P4HTMQ9NXG6 502 aa25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa25.89■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 CDC14CA4D256 554 aa25.89■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ASPDHA6ND91 283 aa25.89■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 SAGE2PA6NJ88 616 aa25.89■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 CFLARO15519 480 aa25.89■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 CT62P0C5K7 136 aa25.89■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 SOX18P35713 384 aa25.89■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 ATP1A4Q13733 1029 aa25.89■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 MLC1Q15049 377 aa25.89■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM111BQ6SJ93 734 aa25.89■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 GALNT12Q8IXK2 581 aa25.89■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 AMER2Q8N7J2 671 aa25.89■■□□□ 1.74
CHCHD4-201ENST00000295767 VPS37AQ8NEZ2 397 aa25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms