RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CatsperbA2RTF1 1109 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn1r12G5E8G1 307 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Htr5bP31387 370 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gpr3P35413 330 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 StacP97306 403 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc30a3P97441 388 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Xkr9Q5GH62 373 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp78Q5U406 512 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm21627Q810R0 219 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc41a2Q8BYR8 573 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc29a4Q8R139 528 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Asb18Q8VHA6 467 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NlnQ91YP2 704 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Aco2Q99KI0 780 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 RtcAQ9D7H3 366 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Phf10Q9D8M7 497 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 D7h11orf16Q9JJR6 402 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 GghQ9Z0L8 317 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mad2l1Q9Z1B5 205 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Heatr5bQ8C547 2070 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cfap77A0A087WRI3 283 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm34653A0A1L1SR01 368 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 FgaE9PV24 789 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr521E9Q519 321 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn1r58G3X9U3 310 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc2a2P14246 523 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 HmgclP38060 325 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nr2f6P43136 390 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccr4P51680 360 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ncf4P97369 339 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zdhhc11Q14AK4 347 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rnf44Q3UHJ8 407 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sel1l2Q3V172 688 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Klra2Q60660 288 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stmnd1Q6P3A1 279 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmeff1Q6PFE7 372 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fmo2Q8K2I3 535 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Chrna3Q8R4G9 499 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr535Q8VGL3 312 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Oas1hQ8VI97 369 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pdzd3Q99MJ6 498 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rpl34Q9D1R9 117 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Csnk1dQ9DC28 415 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tp53bp1P70399 1969 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm21885A0A286YDN8 145 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Xlr5bA2BI50 236 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 EXOC1LB9EK06 172 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn1r14H3BJ46 303 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 5730507C01RikJ3QPX0 416 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Opn1mwO35599 359 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dnajb3O35723 242 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Il1bP10749 269 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lhx3P50481 400 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gabarapl2P60521 117 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 JupQ02257 745 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q3USZ8 430 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Plk5Q4FZD7 595 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Galk2Q68FH4 458 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sdr16c5Q7TQA3 309 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr320Q7TRZ4 306 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fbxo46Q8BG80 603 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Galnt12Q8BGT9 576 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam124bQ8BLQ0 456 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr444Q8VFS6 310 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Klk6Q91Y82 253 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pex11bQ9Z210 259 aa8.57□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cabin1G3X8Q1 2187 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm7792A0A0J9YU01 481 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm3183D3YUJ6 481 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ceacam3E9Q6J4 706 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm3139J3QK78 481 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm3106J3QPH3 481 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ptger3P30557 365 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pitx1P70314 315 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gdf9Q07105 441 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem181aQ3U3W2 474 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm5113Q3UGK8 141 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NkaplQ5SZT7 395 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pon2Q62086 354 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Osgepl1Q6PEB4 414 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Bud31Q6PGH1 103 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dnajc15Q78YY6 149 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lrrtm2Q8BGA3 515 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Chrnb3Q8BMN3 464 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Acp6Q8BP40 418 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gpr157Q8C206 330 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc45a3Q8K0H7 553 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Acsm2Q8K0L3 575 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 GabrpQ8QZW7 440 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn1r200Q8R281 312 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gfm2Q8R2Q4 779 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr1346Q8VGH6 313 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 AjubaQ91XC0 547 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pcdhgb2Q91XX7 928 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Med6Q921D4 246 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sfxn2Q925N2 322 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Yipf2Q99LP8 312 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Syvn1Q9DBY1 612 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pbld1Q9DCG6 288 aa8.56□□□□□ -1.04
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rp1P56716 2095 aa8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 77.4 ms