RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ect2lA0A140LIP2 953 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm29776A0A286YEC0 699 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tgm7A2ART8 616 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3696K7N751 203 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnj1O88335 372 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxb9P20615 250 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpx5P21765 221 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hp1bp3Q3TEA8 554 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eef2kmtQ3UZW7 335 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc17a4Q5NCM1 492 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map4k2Q61161 821 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrtm4Q80XG9 590 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Reep1Q8BGH4 201 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mptx1Q8R1M8 219 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr353Q8VGK0 311 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ranbp3Q9CT10 491 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cxxc1Q9CWW7 660 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D4W2 315 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wwp2Q9DBH0 870 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trpv4Q9EPK8 871 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ing1Q9QXV3 279 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CalcrlQ9R1W5 463 aa12.06□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfhx2Q2MHN3 2562 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7682A0A0J9YUM1 481 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gprin2D3Z1D7 455 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpina3jD3Z451 420 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm340F6RGI3 1242 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tssk2O54863 358 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FesP16879 822 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cst3P21460 140 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 StsP50427 624 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3U7U4 132 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atl1Q8BH66 558 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fate1Q8CEK7 99 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cnot3Q8K0V4 751 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8K207 121 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mterf3Q8R3J4 412 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BniplQ99JU7 328 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HadhbQ99JY0 475 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cadm3Q99N28 396 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PinlypQ9CQD7 212 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gkn2Q9CQS6 184 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl28Q9CR40 571 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acbd7Q9D258 88 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ItpaQ9D892 198 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc19a2Q9EQN9 498 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il21Q9ES17 146 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cldn9Q9Z0S7 217 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rai1Q61818 1889 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex13aA2AFS9 377 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A530032D15RikE9Q422 215 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r31L7N2F1 303 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HgdO09173 445 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Opn1mwO35599 359 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtnd1P03888 318 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eef1a2P62631 463 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FhP97807 507 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syndig1lQ3USQ7 237 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RasefQ5RI75 627 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh12Q5RJH3 794 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sra1Q80VJ2 232 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpeb2Q812E0 521 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf775Q8BI73 538 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cstf2Q8BIQ5 580 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4922Q8C0N0 497 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C1raQ8CG16 707 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adap2Q8R2V5 381 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zdhhc5Q8VDZ4 715 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam69bQ99ML4 431 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx7Q9CY18 387 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Exosc7Q9D0M0 291 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tssc4Q9JHE7 317 aa12.05□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cfap77A0A087WRI3 283 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam136b-psA0A140T8T1 138 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A0A286YD17 136 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp600A2A7V0 737 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp808B8JJZ4 753 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hmox2O70252 315 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcdc2Q5DU00 475 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nr0b2Q62227 260 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sf1Q64213 653 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Megf11Q80T91 1091 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GalpQ810H5 117 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C1rbQ8CFG9 706 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccm2Q8K2Y9 453 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il23rQ8K4B4 644 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elf5Q8VDK3 253 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1302Q8VGE9 315 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr791Q8VGJ0 312 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpinb1aQ9D154 379 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psg23Q9D2U0 471 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psg21Q9DAV5 471 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr630Q9EQQ7 319 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm28576A0A087WRP6 222 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srp54bE9PXC0 504 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TspearJ3S6Y1 670 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tp63O88898 680 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klk1b16P04071 261 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klrb1cP27814 223 aa12.04□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpt1aP97742 773 aa12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.6 ms