Protein–RNA interactions for Protein: L7N2F1

Vmn1r31, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r31L7N2F1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,16■■■■□ 3,06
Vmn1r31L7N2F1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Vmn1r31L7N2F1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Vmn1r31L7N2F1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Vmn1r31L7N2F1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Vmn1r31L7N2F1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Vmn1r31L7N2F1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,42■■■□□ 2,46
Vmn1r31L7N2F1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,41■■■□□ 2,46
Vmn1r31L7N2F1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Vmn1r31L7N2F1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
Vmn1r31L7N2F1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Vmn1r31L7N2F1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Vmn1r31L7N2F1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Vmn1r31L7N2F1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Vmn1r31L7N2F1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Vmn1r31L7N2F1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Vmn1r31L7N2F1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Vmn1r31L7N2F1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Vmn1r31L7N2F1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Vmn1r31L7N2F1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Vmn1r31L7N2F1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Vmn1r31L7N2F1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Vmn1r31L7N2F1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Vmn1r31L7N2F1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Vmn1r31L7N2F1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Vmn1r31L7N2F1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Vmn1r31L7N2F1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,7■■■□□ 2,19
Vmn1r31L7N2F1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Vmn1r31L7N2F1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,56■■■□□ 2,16
Vmn1r31L7N2F1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Vmn1r31L7N2F1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Vmn1r31L7N2F1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Vmn1r31L7N2F1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Vmn1r31L7N2F1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Vmn1r31L7N2F1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Vmn1r31L7N2F1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Vmn1r31L7N2F1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Vmn1r31L7N2F1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Vmn1r31L7N2F1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Vmn1r31L7N2F1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Vmn1r31L7N2F1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
Vmn1r31L7N2F1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Vmn1r31L7N2F1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Vmn1r31L7N2F1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Vmn1r31L7N2F1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Vmn1r31L7N2F1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
Vmn1r31L7N2F1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Vmn1r31L7N2F1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Vmn1r31L7N2F1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Vmn1r31L7N2F1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Vmn1r31L7N2F1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Vmn1r31L7N2F1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Vmn1r31L7N2F1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Vmn1r31L7N2F1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Vmn1r31L7N2F1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Vmn1r31L7N2F1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Vmn1r31L7N2F1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Vmn1r31L7N2F1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Vmn1r31L7N2F1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Vmn1r31L7N2F1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Vmn1r31L7N2F1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Vmn1r31L7N2F1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Vmn1r31L7N2F1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Vmn1r31L7N2F1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Vmn1r31L7N2F1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Vmn1r31L7N2F1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Vmn1r31L7N2F1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Vmn1r31L7N2F1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Vmn1r31L7N2F1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Vmn1r31L7N2F1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Vmn1r31L7N2F1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Vmn1r31L7N2F1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
Vmn1r31L7N2F1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Vmn1r31L7N2F1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Vmn1r31L7N2F1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,76■■□□□ 1,87
Vmn1r31L7N2F1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Vmn1r31L7N2F1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Vmn1r31L7N2F1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Vmn1r31L7N2F1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Vmn1r31L7N2F1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Vmn1r31L7N2F1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Vmn1r31L7N2F1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Vmn1r31L7N2F1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Vmn1r31L7N2F1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Vmn1r31L7N2F1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Vmn1r31L7N2F1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Vmn1r31L7N2F1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Vmn1r31L7N2F1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Vmn1r31L7N2F1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Vmn1r31L7N2F1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Vmn1r31L7N2F1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Vmn1r31L7N2F1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Vmn1r31L7N2F1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Vmn1r31L7N2F1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Vmn1r31L7N2F1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Vmn1r31L7N2F1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Vmn1r31L7N2F1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Vmn1r31L7N2F1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Vmn1r31L7N2F1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Vmn1r31L7N2F1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
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