Protein–RNA interactions for Protein: O09173

Hgd, Homogentisate 1,2-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgdO09173 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
HgdO09173 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HgdO09173 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
HgdO09173 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HgdO09173 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
HgdO09173 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HgdO09173 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
HgdO09173 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
HgdO09173 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HgdO09173 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HgdO09173 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HgdO09173 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HgdO09173 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
HgdO09173 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HgdO09173 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HgdO09173 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HgdO09173 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HgdO09173 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HgdO09173 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HgdO09173 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HgdO09173 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HgdO09173 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HgdO09173 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HgdO09173 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HgdO09173 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HgdO09173 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HgdO09173 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HgdO09173 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HgdO09173 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HgdO09173 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HgdO09173 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HgdO09173 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HgdO09173 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HgdO09173 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HgdO09173 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HgdO09173 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HgdO09173 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HgdO09173 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HgdO09173 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HgdO09173 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HgdO09173 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HgdO09173 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HgdO09173 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HgdO09173 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HgdO09173 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HgdO09173 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HgdO09173 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HgdO09173 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HgdO09173 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HgdO09173 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HgdO09173 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HgdO09173 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HgdO09173 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HgdO09173 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HgdO09173 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HgdO09173 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HgdO09173 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HgdO09173 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HgdO09173 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HgdO09173 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HgdO09173 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HgdO09173 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HgdO09173 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HgdO09173 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HgdO09173 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HgdO09173 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HgdO09173 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HgdO09173 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HgdO09173 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HgdO09173 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HgdO09173 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HgdO09173 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HgdO09173 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HgdO09173 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HgdO09173 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HgdO09173 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HgdO09173 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HgdO09173 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HgdO09173 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HgdO09173 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HgdO09173 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HgdO09173 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HgdO09173 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HgdO09173 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HgdO09173 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HgdO09173 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HgdO09173 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HgdO09173 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HgdO09173 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HgdO09173 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HgdO09173 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HgdO09173 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HgdO09173 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HgdO09173 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HgdO09173 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HgdO09173 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HgdO09173 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HgdO09173 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HgdO09173 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HgdO09173 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms