RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEC23BQ15437 767 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIGD6Q17RP2 521 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF750Q32MQ0 723 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HDDC3Q8N4P3 179 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR4D11Q8NGI4 311 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HERVK_113Q902F9 699 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMPDL3AQ92484 453 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEURL3Q96EH8 262 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL4I1Q96RQ9 567 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 YIPF4Q9BSR8 244 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BTBD2Q9BX70 525 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITPAQ9BY32 194 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SERHL2Q9H4I8 314 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AKIP1Q9NQ31 210 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LMCD1Q9NZU5 365 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPATA7Q9P0W8 599 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BRWD1Q9NSI6 2320 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DOCK8Q8NF50 2099 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HMGN4O00479 90 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCNB2O95067 398 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFNA14P01570 189 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERGP11308 486 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF12P17014 697 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHMP24386 653 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GADD45AP24522 165 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLK1P49759 484 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRKAG1P54619 331 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEC13P55735 322 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CSNK1G2P78368 415 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RUNX3Q13761 415 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IRF4Q15306 451 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CST6Q15828 149 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYPL1Q16563 259 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DGUOKQ16854 277 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RGS21Q2M5E4 152 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C2orf27AQ580R0 203 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAXO2Q658L1 398 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEF8Q6ZN54 512 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COMTD1Q86VU5 262 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LACC1Q8IV20 430 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C7orf61Q8IZ16 206 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 XAGE5Q8WWM1 108 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR26Q9H7D7 661 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNK12Q9HB15 430 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FZD3Q9NPG1 666 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STON1Q9Y6Q2 735 aa11.2□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PS29 197 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANHXE9PGG2 379 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFS4O43181 175 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MFN2O95140 757 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDK1P06493 297 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR12D1P0DN82 309 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RHCEP18577 417 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EN2P19622 333 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CBLP22681 906 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNR2P34972 360 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RXRGP48443 463 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCT3P49368 545 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DOC2BQ14184 412 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INAQ16352 499 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE2UQ5VVX9 321 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCTN3Q6NUS6 607 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF793Q6ZN11 406 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF554Q86TJ5 538 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STX19Q8N4C7 294 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 B3GNT7Q8NFL0 401 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR5P2Q8WZ92 322 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COL21A1Q96P44 957 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C11orf16Q9NQ32 467 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WBP1LQ9NX94 342 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM247A6NEH6 219 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C4orf51C9J302 202 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AIREO43918 545 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HMGA2P52926 109 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF675Q8TD23 568 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GANCQ8TET4 914 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHPT1Q8WUD6 406 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC38A4Q969I6 547 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KXD1Q9BQD3 176 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DPH7Q9BTV6 452 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DCSTAMPQ9H295 470 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRA2Q9H9E1 313 aa11.19□□□□□ -0.62
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HMG20AQ9NP66 347 aa11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms