RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513433.1

SNX25-206, Transcript of sorting nexin 25, human

TSL 3

Gene SNX25, Length 748 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX25-206	ENST00000513433	MAGEA4	P43358	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	GNPDA1	P46926	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	RFX2	P48378	723 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	AGTR2	P50052	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	CLCNKA	P51800	687 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	CTSC	P53634	463 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	GPX6	P59796	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	VSNL1	P62760	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	LTB	Q06643	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	DAG1	Q14118	895 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	ELOC	Q15369	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	GKN2	Q86XP6	184 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	OR2L2	Q8NH16	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	OR4C6	Q8NH72	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	CDKL2	Q92772	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	CLPB	Q9H078	707 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	SPAST	Q9UBP0	616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433		A6NCN8	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	MGAT4D	A6NG13	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433		A6NNC1	897 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	ACOT8	O14734	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	RIPK2	O43353	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	SDC3	O75056	442 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	NDUFS3	O75489	264 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	ACSL3	O95573	720 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	GIMD1	P0DJR0	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	ALPPL2	P10696	532 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	ACP5	P13686	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	F3	P13726	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	CTSE	P14091	401 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	SLC2A4	P14672	509 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	VCL	P18206	1134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	CD9	P21926	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	ATP5D	P30049	168 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	ACTR1B	P42025	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	CCR10	P46092	362 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	CD151	P48509	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	LIMK2	P53671	638 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	PMS2	P54278	862 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	ACTR1A	P61163	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNX25-206	ENST00000513433	MPP1	Q00013	466 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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