RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590694.5

NEDD4L-231, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 165 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	SPG21	Q9NZD8	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	TRANK1	O15050	2925 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694		A0A0G2JMZ2	1700 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	AKAP3	O75969	853 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	DNA2	P51530	1060 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	DEFB103A	P81534	67 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	AK9	Q5TCS8	1911 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	USP34	Q70CQ2	3546 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	KLF11	O14901	512 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	SCO2	O43819	266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	KRT33A	O76009	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	YES1	P07947	543 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	MAGEA11	P43364	429 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	MAGEB1	P43366	347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	CLDN17	P56750	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	KCNJ10	P78508	379 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	ARF5	P84085	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	CETN1	Q12798	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	NPRL3	Q12980	569 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	EXT1	Q16394	746 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	SGCB	Q16585	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR2T11	Q8NH01	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	DYRK2	Q92630	601 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	SNX21	Q969T3	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	RASL10B	Q96S79	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	SIPA1L1	O43166	1804 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEDD4L-231	ENST00000590694	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms