RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558639.5

PSMA4-208, Transcript of proteasome subunit alpha 4, human

TSL 3

Gene PSMA4, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA4-208	ENST00000558639	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	7.16	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	POLG2	Q9UHN1	485 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	ICK	Q9UPZ9	632 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	CDYL	Q9Y232	598 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	SPTB	P11277	2137 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	MED13	Q9UHV7	2174 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	DIRC3	C9JPN6	131 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639		E5RI56	91 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	HCRTR1	O43613	425 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	KLHL41	O60662	606 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	AVIL	O75366	819 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	CEACAM4	O75871	244 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	KRT38	O76015	456 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	AP2A2	O94973	939 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	PRSS23	O95084	383 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	FTH1	P02794	183 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	ALPP	P05187	535 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	CD63	P08962	238 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	MYZAP	P0CAP1	466 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	PSMA3	P25788	255 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	ITGA3	P26006	1051 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	GRIA1	P42261	906 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	GRIA3	P42263	894 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	SERPINB9	P50453	376 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	UCP3	P55916	312 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	VSNL1	P62760	191 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	CRADD	P78560	199 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	TMED2	Q15363	201 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	CYP2A13	Q16696	494 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	DCAF10	Q5QP82	559 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF534	Q76KX8	674 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	HPS6	Q86YV9	775 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	IQCK	Q8N0W5	287 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	GALNT16	Q8N428	558 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639		Q8NA96	180 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	IP6K3	Q96PC2	410 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	PANX3	Q96QZ0	392 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	OR2A14	Q96R47	310 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	CPNE1	Q99829	537 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	VPS11	Q9H270	941 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	TREX1	Q9NSU2	369 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	C5AR2	Q9P296	337 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	FETUB	Q9UGM5	382 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	TENM4	Q6N022	2769 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PSMA4-208	ENST00000558639	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		7.15	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639		A0A087WWL8	130 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639		A0A0J9YY10	115 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	OR1I1	O60431	355 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	ACSL3	O95573	720 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	DDAH2	O95865	285 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	IGHE	P01854	428 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	RNF224	P0DH78	156 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	ACADL	P28330	430 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	NMBR	P28336	390 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	MSH2	P43246	934 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PSMA4-208	ENST00000558639	ZIC1	Q15915	447 aa		7.14	□□□□□ -1.27

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