RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 GDAP1Q8TB36 358 aa4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 CHURC1Q8WUH1 139 aa4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 ZFAND2BQ8WV99 257 aa4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 C1orf54Q8WWF1 131 aa4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 ERP27Q96DN0 273 aa4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D31Q96DN5 1066 aa4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 PERPQ96FX8 193 aa4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 CCDC77Q9BR77 488 aa4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 OSBPL8Q9BZF1 889 aa4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 RAB20Q9NX57 234 aa4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 ANAPC5Q9UJX4 755 aa4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 WDR37Q9Y2I8 494 aa4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 LRRC42Q9Y546 428 aa4.01□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 CLUHO75153 1309 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 SCN9AQ15858 1988 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 ELOVL7A1L3X0 281 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 SIGLEC16A6NMB1 481 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 H0YCG3 227 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 ALOX15BO15296 676 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 TM9SF1O15321 606 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 ZWINTO95229 277 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 TGDSO95455 350 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 LSM8O95777 96 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 RPSAP08865 295 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 LINGO3P0C6S8 592 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 RALAP11233 206 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 TMEM11P17152 192 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 CALRP27797 417 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 PTPN4P29074 926 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 ALDH1B1P30837 517 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 ALDH3A1P30838 453 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 YWHABP31946 246 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 SFNP31947 248 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 CETN2P41208 172 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 NSFP46459 744 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 PGFP49763 221 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 VCPP55072 806 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 PSMC5P62195 406 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 PLA2G7Q13093 441 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 DNAJC3Q13217 504 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 TAZQ16635 292 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 UGCGQ16739 394 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 KLHL38Q2WGJ6 581 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 FKBP1CQ5VVH2 108 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 IRGCQ6NXR0 463 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 FAM47EQ6ZV65 393 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 NLRP9Q7RTR0 991 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 ZNF354CQ86Y25 554 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 GPD1LQ8N335 351 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 SKA1Q96BD8 255 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 MOAP1Q96BY2 351 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 SLC22A12Q96S37 553 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 HGH1Q9BTY7 390 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 CCDC28BQ9BUN5 200 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 WWTR1Q9GZV5 400 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 TRABDQ9H4I3 376 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 ACP6Q9NPH0 428 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D22BQ9NU19 505 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 GRID1Q9ULK0 1009 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 ASB3Q9Y575 518 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 STYXL1Q9Y6J8 313 aa4□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 LOC285556D6RIA3 1793 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 WDR46O15213 610 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 SLC16A4O15374 487 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 NDUFS4O43181 175 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 TOM1O60784 492 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 SPAG6O75602 509 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 NEBLO76041 1014 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 STBD1O95210 358 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 HLA-DRAP01903 254 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 CALB1P05937 261 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 GPIP06744 558 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 ACADMP11310 421 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 GLRA2P23416 452 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 PHBP35232 272 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 VHLP40337 213 aa3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SGCE-211ENST00000522045 RAP1GDS1P52306 607 aa3.99□□□□□ -1.77
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