RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 NUDT13Q86X67 352 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 DOK4Q8TEW6 326 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SLX1AQ9BQ83 275 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL1Q9NR64 748 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ASB4Q9Y574 426 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 NCKAP5O14513 1909 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 GLOD5A6NK44 160 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 G3V2L1 256 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 GLRA3O75311 464 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 NEURL1O76050 574 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 OTCP00480 354 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 PDYNP01213 254 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 PROCP04070 461 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 IFNA16P05015 189 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 GSTA1P08263 222 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT15P19012 456 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 TAC1P20366 129 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 HTR6P50406 440 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 TDGF1P3P51864 188 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 MLF1P58340 268 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 FOLH1Q04609 750 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 STX4Q12846 297 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF766Q5HY98 468 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SPINK14Q6IE38 97 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR180Q86V85 440 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 LCA5Q86VQ0 697 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF227Q86WZ6 799 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 TDRPQ86YL5 185 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 C4orf33Q8N1A6 199 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CDYL2Q8N8U2 506 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 FAR1Q8WVX9 515 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 VMP1Q96GC9 406 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNA7Q96RP8 456 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC77Q9BR77 488 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CENPKQ9BS16 269 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 GSTO2Q9H4Y5 243 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 TRPS1Q9UHF7 1281 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 PPT2Q9UMR5 302 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PR48 441 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKUB1A6NFN9 424 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM200CA6NKL6 621 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 C17orf105B2RV13 164 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 HRKO00198 91 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 WISP2O76076 250 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SEMA3DO95025 777 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SLU7O95391 586 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 DDAH2O95865 285 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 NR2F6P10588 404 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CLCN2P51788 898 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKAA2P54646 552 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 IFT88Q13099 833 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 RCN2Q14257 317 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 LGI4Q8N135 537 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM26EQ8N5C1 309 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR7Q8TB68 274 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 L3HYPDHQ96EM0 354 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SCMH1Q96GD3 660 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF382Q96SR6 550 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINI1Q99574 410 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB126Q9BYW3 111 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 OR8D2Q9GZM6 311 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ELOVL6Q9H5J4 265 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 OLAHQ9NV23 265 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 VTI1BQ9UEU0 232 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 PHF11Q9UIL8 331 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SPACA6W5XKT8 324 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 POLEQ07864 2286 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ICE1Q9Y2F5 2266 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 PROM1O43490 865 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM58BPP0C7Q3 252 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 MST1P26927 711 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 INAQ16352 499 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP20A1Q6UW02 462 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ZYG11AQ6WRX3 759 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 MMP21Q8N119 569 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ARMC10Q8N2F6 343 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 BCORP1Q8N888 145 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP2-218ENST00000511185 OR14A16Q8NHC5 309 aa17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms