RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288050.8

PDPR-201, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 9,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-201ENST00000288050 ADGRB2O60241 1585 aa9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 IQCF5A8MTL0 148 aa9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 A8MUI8 341 aa9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 OR5H8P0DN80 308 aa9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 OR52W1Q6IF63 320 aa9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 PTPN18Q99952 460 aa9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 POLE4Q9NR33 117 aa9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 LRRTM2O43300 516 aa9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 RPP40O75818 363 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 DFFBO76075 338 aa9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 ALDOBP05062 364 aa9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 TMEM11P17152 192 aa9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 UBE2KP61086 200 aa9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 DNERQ8NFT8 737 aa9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 ZNF251Q9BRH9 671 aa9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 PLLPQ9Y342 182 aa9.56□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 PTPRJQ12913 1337 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 SREBF1P36956 1147 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 GRB10Q13322 594 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 CYP2W1Q8TAV3 490 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 ZNF416Q9BWM5 594 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 COQ3Q9NZJ6 369 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 OR2M5A3KFT3 312 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 SLC22A2O15244 555 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 KDELR3O43731 214 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 RDH16O75452 317 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 CREB1P16220 341 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 CCNFP41002 786 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 SP2Q02086 613 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 ACY1Q03154 408 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 LIX1LQ8IVB5 337 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 MROQ9BYG7 248 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 K7EQM0 130 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 SLC1A7O00341 560 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 DFNA5O60443 496 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 SDC3O75056 442 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 MAP2K3P46734 347 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 BCL2L15Q5TBC7 163 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 FIBCD1Q8N539 461 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 NUDT9Q9BW91 350 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 COQ10BQ9H8M1 238 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 SCML2Q9UQR0 700 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 DLG5Q8TDM6 1919 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 ANKUB1A6NFN9 424 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 PEX12O00623 359 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 TOR1AO14656 332 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 TFP02787 698 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 BPGMP07738 259 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 F2RP25116 425 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 G0S2P27469 103 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 ERVK-21P61565 698 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 RAB11BQ15907 218 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 RBP7Q96R05 134 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 OR4K3Q96R72 315 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 CLEC4EQ9ULY5 219 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 DNAJB6O75190 326 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 FIGNQ5HY92 759 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 RABL3Q5HYI8 236 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 IFI44Q8TCB0 444 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 COL21A1Q96P44 957 aa9.55□□□□□ -0.88
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PDPR-201ENST00000288050 RNF32Q9H0A6 362 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.55□□□□□ -0.88
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PDPR-201ENST00000288050 MTX2O75431 263 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 C8GP07360 202 aa9.55□□□□□ -0.88
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PDPR-201ENST00000288050 PHF19Q5T6S3 580 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 PAOXQ6QHF9 649 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 OR5M3Q8NGP4 307 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 DEDD2Q8WXF8 326 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 MTMR9Q96QG7 549 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 LRRC3Q9BY71 257 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 C3P01024 1663 aa9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PDPR-201ENST00000288050 RPIAP49247 311 aa9.55□□□□□ -0.88
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