RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 MYZAPP0CAP1 466 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 SERPINB4P48594 390 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 GPR143P51810 404 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 RAE1P78406 368 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 BTBD16Q32M84 506 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 COLEC12Q5KU26 742 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CLEC6AQ6EIG7 209 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 TRIM46Q7Z4K8 759 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 OR4N5Q8IXE1 308 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ELP5Q8TE02 316 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 APIPQ96GX9 242 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 AGAP4Q96P64 663 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 NPAS2Q99743 824 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 MMP25Q9NPA2 562 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 VTI1BQ9UEU0 232 aa20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 BLACEA4D250 179 aa20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 TM9SF1O15321 606 aa20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 SUV39H1O43463 412 aa20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 AIFM1O95831 613 aa20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 FGF4P08620 206 aa20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 UROSP10746 265 aa20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ID2Q02363 134 aa20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 ASPHQ12797 758 aa20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 UGT3A2Q3SY77 523 aa20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CYP20A1Q6UW02 462 aa20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 SIRT6Q8N6T7 355 aa20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 TM4SF18Q96CE8 201 aa20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 SPACA6W5XKT8 324 aa20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa20.84■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 PGRMC2O15173 223 aa20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 C19orf57Q0VDD7 668 aa20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 KLRB1Q12918 225 aa20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 EXT1Q16394 746 aa20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 NADK2Q4G0N4 442 aa20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 PAGE2Q7Z2X7 111 aa20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 APCDD1LQ8NCL9 501 aa20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 TANKQ92844 425 aa20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 LMF1Q96S06 567 aa20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 TUBB1Q9H4B7 451 aa20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 NMRK1Q9NWW6 199 aa20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 PTGFRNQ9P2B2 879 aa20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 CSAG2Q9Y5P2 127 aa20.83■□□□□ 0.93
SYF2-201ENST00000236273 GLOD5A6NK44 160 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 AZIN1O14977 448 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 KLHL41O60662 606 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 FOLH1Q04609 750 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 CRB2Q5IJ48 1285 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 KANK2Q63ZY3 851 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 HPS6Q86YV9 775 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 NUDCD3Q8IVD9 361 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 KIF2BQ8N4N8 673 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 DNAJB14Q8TBM8 379 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ARL8AQ96BM9 186 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 KCNK9Q9NPC2 374 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 SIRT5Q9NXA8 310 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa20.82■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 WDR91A4D1P6 747 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 TMEM233B4DJY2 109 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 BIRC5O15392 142 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 MAN1A2O60476 641 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 MYO1DO94832 1006 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ZWINTO95229 277 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ALPPP05187 535 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 NR2F6P10588 404 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 STX4Q12846 297 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 MFAP5Q13361 173 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 TERF2Q15554 542 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 GALNT18Q6P9A2 607 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 LINC00696Q6ZRV3 163 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 RNF165Q6ZSG1 346 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZSR9 355 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 MMP21Q8N119 569 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 TEX19Q8NA77 164 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ADAP2Q9NPF8 381 aa20.81■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 CES1P1Q9UKY3 287 aa20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms