RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm5936A2BG95 728 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm5640A3KG49 728 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Eftud2O08810 971 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 UgdhO70475 493 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gh1P06880 216 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fv4P11370 679 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cd79aP11911 220 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arf3P61205 181 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fezf1Q0VDQ9 475 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Klhdc10Q6PAR0 439 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem121Q80XA0 318 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kiaa0895lQ810A5 467 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rbm45Q8BHN5 476 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q8C3W1 322 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 RergQ8R367 199 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sh3glb2Q8R3V5 400 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Man2c1Q91W89 1039 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DgkgQ91WG7 788 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q9DAE7 121 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 IkbipQ9DBZ1 373 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 HrgQ9ESB3 525 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Npas3Q9QZQ0 925 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TinagQ9WUR0 475 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Eci2Q9WUR2 391 aa20.37■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ssxa1B1AUS7 101 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rundc3aO08576 446 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PrkcshO08795 521 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc1a6O35544 561 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ctnnd2O35927 1247 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rph3aP47708 681 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tsc22d1P62500 1077 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SctQ08535 133 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rnf40Q3U319 1001 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prmt9Q3U3W5 846 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm10775Q3V290 127 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc25a45Q8CFJ7 288 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Il17rdQ8JZL1 738 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CenpiQ8K1K4 746 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mgat5Q8R4G6 740 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 FggQ8VCM7 436 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Clec2fQ8VI21 196 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppp6cQ9CQR6 305 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 2610042L04RikQ9D073 150 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnmb4Q9JIN6 210 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rnf11Q9QYK7 154 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pdcd7Q9WTY1 482 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gipc1Q9Z0G0 333 aa20.36■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Usp9yF8VPU6 2556 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Adgrg4B7ZCC9 3073 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm17949A0A1B0GRV7 212 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Smpd5D6MZJ6 483 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 F2rl3O88634 396 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Agtr2P35374 363 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sirt6P59941 334 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arl1P61211 181 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Defb2P82020 71 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pitpnm3Q3UHE1 974 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CamkvQ3UHL1 512 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cfhr1Q61406 343 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vsx2Q61412 361 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Doc2aQ7TNF0 405 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q8BGA7 448 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc35c1Q8BLX4 363 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Il25Q8VHH8 169 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 RabifQ91X96 123 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Psmd9Q9CR00 222 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Exosc7Q9D0M0 291 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 9230110F15RikQ9D262 117 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cldn9Q9Z0S7 217 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 VarsQ9Z1Q9 1263 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ptdss2Q9Z1X2 473 aa20.35■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vmn1r90A0A087WR36 309 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr839-ps1A0A1D5RMH6 312 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm12666A2AMD0 254 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 LexmA2AVQ5 414 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Osbpl8B9EJ86 889 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp26P10076 861 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pou4f1P17208 421 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MagP20917 626 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 RxrbP28704 520 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Padi2Q08642 673 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Spag6Q3V0U9 509 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Grm7Q68ED2 915 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abhd10Q6PE15 297 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nudt9Q8BVU5 350 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 C1saQ8CG14 688 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trim31Q8R0K2 507 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DolkQ8R2Y3 534 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Akr1c20Q8VC77 323 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr1512Q8VF72 313 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ChiaQ91XA9 473 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tnfrsf22Q9ER62 198 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Chrac1Q9JKP8 129 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DmtnQ9WV69 405 aa20.34■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cytl1A1E5L0 139 aa20.33■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NumblO08919 604 aa20.33■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dhcr7O88455 471 aa20.33■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Il2raP01590 268 aa20.33■□□□□ 0.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Apoa4P06728 395 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.7 ms