RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SCAMP1	O15126	338 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	VEGFD	O43915	354 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CBFA2T3	O75081	653 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SULT1C4	O75897	302 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	RB1	P06400	928 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	HSMCR30	P0CW71	290 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ARAF	P10398	606 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ITGA2	P17301	1181 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TGFBR2	P37173	567 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF846	Q147U1	533 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	INA	Q16352	499 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	KLK6	Q92876	244 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PIP5K1A	Q99755	562 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ITPA	Q9BY32	194 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CERS4	Q9HA82	394 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	MYO9B	Q13459	2157 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	FUOM	A2VDF0	154 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CLCA1	A8K7I4	914 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	C5orf58	C9J3I9	102 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	NFATC1	O95644	943 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	RXRG	P48443	463 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CLCNKA	P51800	687 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TIGD6	Q17RP2	521 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM16L	Q309B1	348 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM240	Q5SV17	173 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	LCTL	Q6UWM7	567 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM245	Q9H330	911 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PALMD	Q9NP74	551 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	OR1F1	O43749	312 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	GAST	P01350	101 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	IFNA14	P01570	189 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	IFNW1	P05000	195 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	BMP4	P12644	408 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	DDC	P20711	480 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	XCR1	P46094	333 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CRISP3	P54108	245 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TP53BP2	Q13625	1128 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	12.47	□□□□□ -0.41	5e-6	■□□□□ 10.2
BRF1-222	ENST00000635152	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PNCK	Q6P2M8	343 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	STX19	Q8N4C7	294 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	AMER3	Q8N944	861 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	XKR8	Q9H6D3	395 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	AHSP	Q9NZD4	102 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TRANK1	O15050	2925 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152		M0R082	166 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	AIRE	O43918	545 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	UQCRC2	P22695	453 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINB10	P48595	397 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	LIM2	P55344	173 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CDK3	Q00526	305 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	IFITM3	Q01628	133 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ST3GAL4	Q11206	333 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	MAPK11	Q15759	364 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	REEP3	Q6NUK4	255 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41

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