RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 ROGDIQ9GZN7 287 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 LYRM4Q9HD34 91 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ADGRE2Q9UHX3 823 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TEKT2Q9UIF3 430 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 RNF11Q9Y3C5 154 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 OR5H15A6NDH6 313 aa16.6■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 A8MT66 165 aa16.6■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 A8MUI8 341 aa16.6■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 PLPP1O14494 284 aa16.6■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 PPP2R1BP30154 601 aa16.6■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 SSR2P43308 183 aa16.6■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 RPS13P62277 151 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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CS-219ENST00000550655 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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CS-219ENST00000550655 BEST3Q8N1M1 668 aa16.6■□□□□ 0.25
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CS-219ENST00000550655 ZNF354BQ96LW1 612 aa16.6■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 CDK15Q96Q40 435 aa16.6■□□□□ 0.25
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CS-219ENST00000550655 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
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CS-219ENST00000550655 TMEM216Q9P0N5 145 aa16.6■□□□□ 0.25
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CS-219ENST00000550655 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
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CS-219ENST00000550655 TRAV17A0A0B4J275 112 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 A8MUA0 341 aa16.59■□□□□ 0.25
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CS-219ENST00000550655 ETHE1O95571 254 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 SHBGP04278 402 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 NR6A1Q15406 480 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TERF2Q15554 542 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 CLNKQ7Z7G1 428 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 REPS1Q96D71 796 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 NTMT1Q9BV86 223 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 STMN3Q9NZ72 180 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ESPL1Q14674 2120 aa16.58■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 PTPN13Q12923 2485 aa16.58■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 A0A1B0GTL3 188 aa16.58■□□□□ 0.24
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CS-219ENST00000550655 CCNG1P51959 295 aa16.58■□□□□ 0.24
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CS-219ENST00000550655 RCN2Q14257 317 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 MEP1AQ16819 746 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 AP5B1Q2VPB7 878 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 OR4C11Q6IEV9 310 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 LCA5Q86VQ0 697 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 LGI4Q8N135 537 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 SLC5A8Q8N695 610 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 APCDD1LQ8NCL9 501 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 ACMSDQ8TDX5 336 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 GRHL3Q8TE85 626 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 PRM3Q9NNZ6 103 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 PPT2Q9UMR5 302 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 LRRK2Q5S007 2527 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 COL12A1Q99715 3063 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 GOLGA8RI6L899 631 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 CTNSO60931 367 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 MYO1DO94832 1006 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 ST13P50502 369 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 GPR143P51810 404 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 NEK2P51955 445 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 RAP1GDS1P52306 607 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 ARFIP1P53367 373 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 TAS2R50P59544 299 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 PHEXP78562 749 aa16.57■□□□□ 0.24
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CS-219ENST00000550655 TUBA3CQ13748 450 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 INAQ16352 499 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 GGTA1PQ4G0N0 100 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 ARMC10Q8N2F6 343 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 MDS2Q8NDY4 140 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-219ENST00000550655 B3GNT7Q8NFL0 401 aa16.57■□□□□ 0.24
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