RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368378.7

THBS3-201, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,145 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-201ENST00000368378 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 TRPS1Q9UHF7 1281 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 WNT6Q9Y6F9 365 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 A6NCN8 305 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 SMLR1H3BR10 107 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 K7ESM1 405 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 ZW10O43264 779 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 APOA1P02647 267 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 CD9P21926 228 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 PTPN6P29350 595 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 WASP42768 502 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 CRYBA2P53672 197 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 EPHB3P54753 998 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 AP1S1P61966 158 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 MAP4K2Q12851 820 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 GAREM2Q75VX8 874 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 LAX1Q8IWV1 398 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 ESX1Q8N693 406 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 SYT14Q8NB59 555 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 PJA1Q8NG27 643 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 OR7G3Q8NG95 312 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 S100ZQ8WXG8 99 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 USP7Q93009 1102 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 SLC38A4Q969I6 547 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 OR4K3Q96R72 315 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 NTMT1Q9BV86 223 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 NDUFAF4Q9P032 175 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 TRBC2A0A5B9 178 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 OR2A25A4D2G3 310 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 DSCR3O14972 297 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 GASTP01350 101 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 C1SP09871 688 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 PRPS2P11908 318 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 SELPP16109 830 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 PSMB5P28074 263 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 MAPK1P28482 360 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 PPP5CP53041 499 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 WNT3P56703 355 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 ELP6Q0PNE2 266 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 INSL4Q14641 139 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 PAMR1Q6UXH9 720 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 STARD8Q92502 1023 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 RDH12Q96NR8 316 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 MGLLQ99685 303 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 DUSP21Q9H596 190 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 NEK6Q9HC98 313 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 COMMD3Q9UBI1 195 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 SOBPA7XYQ1 873 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 SLC16A6O15403 523 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 IDH3BO43837 385 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 ENTPD6O75354 484 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 UPK1BO75841 260 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 RYKP34925 604 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 TGFBR2P37173 567 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 NRIP1P48552 1158 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 SLC16A1P53985 500 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 KCNJ10P78508 379 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 WDR45BQ5MNZ6 344 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 CEACAM20Q6UY09 585 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 FAM124AQ86V42 546 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 PPCDCQ96CD2 204 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 YIPF6Q96EC8 236 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 CMTM7Q96FZ5 175 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 TBX5Q99593 518 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 CWH43Q9H720 699 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 IFT52Q9Y366 437 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 AGAP5A6NIR3 686 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-201ENST00000368378 M0R3H8 397 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms