RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 MS4A15Q8N5U1 240 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 SPERTQ8NA61 448 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 PWWP2AQ96N64 755 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 CMAHPQ9Y471 501 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ARID1AO14497 2285 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 BRWD1Q9NSI6 2320 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 FLRT2O43155 660 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 PROM1O43490 865 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 IFNA1P01562 189 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ARSFP54793 590 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 UPP1Q16831 310 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.8□□□□□ -1.48
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PTPRT-201ENST00000356100 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 PYCR2Q96C36 320 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 KLHDC7BQ96G42 594 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 P2RY13Q9BPV8 354 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 C4BP0C0L5 1744 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 C5P01031 1676 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0U1RQJ8 604 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 TTC34A8MYJ7 566 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 TULP2O00295 520 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 GNB5O14775 395 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 CDK2P24941 298 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 TPTEP56180 551 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC20Q8TCA0 184 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 NKD1Q969G9 470 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 PKP4Q99569 1192 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ASXL3Q9C0F0 2248 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 OAZ2O95190 189 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ITGA5P08648 1049 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 HTR3AP46098 478 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 MXD1Q05195 221 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 GRM2Q14416 872 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 TCTE1Q5JU00 501 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 GALNT12Q8IXK2 581 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 DBF4BQ8NFT6 615 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 LRRN4Q8WUT4 740 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 BRF2Q9HAW0 419 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ALS2Q96Q42 1657 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 CEP250Q9BV73 2442 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 LSM1O15116 133 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 RNH1P13489 461 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 GDI1P31150 447 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 FMO3P31513 532 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 GBX1Q14549 363 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 CHRFAM7AQ494W8 412 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 RAB11FIP2Q7L804 512 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 C14orf80Q86SX3 495 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ASPGQ86U10 573 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF584Q8IVC4 421 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF559Q9BR84 538 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 WDR45Q9Y484 360 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 B4DGG1 531 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF878C9JN71 531 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ACOT7O00154 380 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF217O75362 1048 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 NPY5RQ15761 445 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ENPP7Q6UWV6 458 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 EPHA6Q9UF33 1036 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 DHDHQ9UQ10 334 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 NRP1O14786 923 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 PCDHGA12O60330 932 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 DGKZQ13574 1117 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 GFOD2Q3B7J2 385 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ARSIQ5FYB1 569 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 RAB41Q5JT25 222 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 DCAF12L1Q5VU92 463 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ZDHHC24Q6UX98 284 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ISLR2Q6UXK2 745 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 Q6ZVU0 165 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 LRCH3Q96II8 777 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 CENPOQ9BU64 300 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 STUB1Q9UNE7 303 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 PHIPQ8WWQ0 1821 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 SLITRK5O94991 958 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 PTGS2P35354 604 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 C2orf27AQ580R0 203 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 GPRC6AQ5T6X5 926 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 SLC22A10Q63ZE4 541 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 DHRS1Q96LJ7 313 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.79□□□□□ -1.48
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