RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MROH6A6NGR9 719 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC10BA6NIK2 292 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HACD1B0YJ81 288 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 E7ENX8 843 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35G6P0C7Q6 338 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRD5A1P18405 259 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTNNA2P26232 953 aa9.34□□□□□ -0.91
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IDUAP35475 653 aa9.34□□□□□ -0.91
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2HP62256 183 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAP2Q03519 686 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HERC3Q15034 1050 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF534Q76KX8 674 aa9.34□□□□□ -0.91
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PANX3Q96QZ0 392 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HEMGNQ9BXL5 484 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACKR4Q9NPB9 350 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF148Q9UQR1 794 aa9.34□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC22A7Q9Y694 548 aa9.34□□□□□ -0.91
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC3CA6NJW4 275 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD8B2A6NJW9 211 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A8MXE2 369 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYO1CO00159 1063 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFS4O43181 175 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AVILO75366 819 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MATN4O95460 622 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACSL3O95573 720 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLAUP00749 431 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H2AFZP0C0S5 128 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALOX12P18054 663 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLCO1A2P46721 670 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB8AP61006 207 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TOMM20Q15388 145 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.33□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 23
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H2AFVQ71UI9 128 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PM20D2Q8IYS1 436 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.33□□□□□ -0.92
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANAPC5Q9UJX4 755 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.33□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF839A8K0R7 811 aa9.32□□□□□ -0.92
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KPNA5O15131 536 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEP104O60308 925 aa9.32□□□□□ -0.92
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFNA16P05015 189 aa9.32□□□□□ -0.92
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSD17B2P37059 387 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDKN1AP38936 164 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DIO3P55073 304 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFA6Q01524 100 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYL5Q02045 173 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNJ11Q14654 390 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHL38Q2WGJ6 581 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCST1Q5T197 706 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OPN5Q6U736 354 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLNKQ7Z7G1 428 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANGPTL4Q9BY76 406 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRDM14Q9GZV8 571 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.32□□□□□ -0.92
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