RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 CLCA1A8K7I4 914 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 TOR1BO14657 336 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 IL3P08700 152 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 CD36P16671 472 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 GABRB1P18505 474 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 CDH12P55289 794 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ATP1A4Q13733 1029 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 NIPAL1Q6NVV3 410 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 SLC30A8Q8IWU4 369 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 LGI4Q8N135 537 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 DENND6BQ8NEG7 585 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 MYDGFQ969H8 173 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 PIP5K1AQ99755 562 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 MROQ9BYG7 248 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 SLC6A16Q9GZN6 736 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ACER3Q9NUN7 267 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 MMP20O60882 483 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ADRB3P13945 408 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ALDH4A1P30038 563 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 BCAP31P51572 246 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 OXA1LQ15070 435 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM52BQ4KMG9 183 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF605Q86T29 641 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 SLC9B2Q86UD5 537 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC103Q8IW40 242 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 OR52J3Q8NH60 311 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 OR8D1Q8WZ84 308 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 RAD51AP1Q96B01 352 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 TAAR2Q9P1P5 351 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 OSGIN1Q9UJX0 560 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 CDK1P06493 297 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 CTNNB1P35222 781 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 KRT78Q8N1N4 520 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 OR5AK3PQ8NH89 298 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 GGHQ92820 318 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 PPP1R16AQ96I34 528 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ALPK1Q96QP1 1244 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 FAM129BQ96TA1 746 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 RAD9AQ99638 391 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 C11orf49Q9H6J7 331 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ANKHQ9HCJ1 492 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 IRAK4Q9NWZ3 460 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF226Q9NYT6 803 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ANGPT4Q9Y264 503 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ENPP4Q9Y6X5 453 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 PRAMEF10O60809 474 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 UQCRC2P22695 453 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 KELP23276 732 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 LIPAP38571 399 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 SLC19A1P41440 591 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 RPA4Q13156 261 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ADCK1Q86TW2 530 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 PDZD3Q86UT5 571 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 EGFL6Q8IUX8 553 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 DEPDC4Q8N2C3 294 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 RSPRY1Q96DX4 576 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 RHBGQ9H310 441 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 AHSPQ9NZD4 102 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ASF1AQ9Y294 204 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ARRDC5A6NEK1 342 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 M0R082 166 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 TBX19O60806 448 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 SEMA3DO95025 777 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ERGP11308 486 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 UGT2B10P36537 528 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 CD97P48960 835 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 PROX1Q92786 737 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 PDXPQ96GD0 296 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 IL17FQ96PD4 163 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 MIEF1Q9NQG6 463 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CLDN11-201ENST00000064724 EFCAB9A8MZ26 197 aa16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms