RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032487.13

Vamp1-201, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vamp1, Length 2,772 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fam120bQ6RI63 786 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 LppQ8BFW7 613 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Wdfy2Q8BUB4 400 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Asrgl1Q8C0M9 326 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Q8K039 155 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr622Q8VGY7 317 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc3a1Q91WV7 685 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mcoln1Q99J21 580 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Atoh8Q99NA2 322 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mrpl45Q9D0Q7 306 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slco6d1Q9D5W6 683 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tprg1lQ9DBS2 266 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pbld1Q9DCG6 288 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cntnap5aQ0V8T9 1304 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem265E9Q8G3 109 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm10269G3UWD7 123 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Galnt9G3X942 604 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mtco1P00397 514 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Abcb1bP06795 1276 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 CtslP06797 334 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp59P16373 634 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ccnb2P30276 398 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 StradaQ3UUJ4 431 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Foxj1Q61660 421 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Usp7Q6A4J8 1103 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Alg8Q6P8H8 526 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Enkd1Q7TSV9 346 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Asphd2Q80VP9 343 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nipal3Q8BGN5 410 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ptges2Q8BWM0 384 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Wdr11Q8K1X1 1223 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gpat4Q8K2C8 456 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Glb1lQ8VC60 646 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr437Q8VEV1 310 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr695Q8VFM3 315 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Arrb2Q91YI4 410 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Galnt11Q921L8 608 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Klhl22Q99JN2 634 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pdzk1ip1Q9CQH0 114 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lrrc40Q9CRC8 602 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp84Q9D654 559 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cers5Q9D6K9 414 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Stra6lQ9DBN1 621 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Hapln2Q9ESM3 341 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc7a7Q9Z1K8 510 aa11.2□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr419E9Q0Y7 313 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr420E9Q4G0 321 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Glyatl3E9Q5L8 290 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp616J3QN14 987 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mpzl2O70255 215 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Meox2P32443 303 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 RenbpP82343 430 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 MylpfP97457 169 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fam109bQ14B98 259 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Teddm2Q208S0 260 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem237Q3V0J1 427 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm5800Q497L3 186 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dyrk2Q5U4C9 599 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zbtb5Q7TQG0 670 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 NapepldQ8BH82 396 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mab21l2Q8BPP1 359 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ctdsp2Q8BX07 270 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Agr3Q8R3W7 165 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr561Q8VGZ6 314 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Asb15Q8VHS6 583 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Glod4Q9CPV4 298 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 1700029F12RikQ9CRB4 147 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 4930524N10RikQ9D519 233 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 2200002D01RikQ9D809 114 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr71Q9QZ18 312 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Eif4hQ9WUK2 248 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Itgb6Q9Z0T9 787 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Smim10l2aA0A0B4J1F8 78 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mmp27D3YV89 551 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 F2P19221 618 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sox3P53784 375 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Npas1P97459 594 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rgs14P97492 547 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tcf7Q00417 419 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Bpifa6Q0VGU8 367 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Arnt2Q61324 712 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem270Q6UJB9 264 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp189Q8BKP2 608 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cfap20Q8BTU1 193 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Prr33Q8C494 260 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr808Q8VGI8 312 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cryzl1Q921W4 348 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem80Q9D3H0 123 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mettl7bQ9DD20 244 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Plag1Q9QYE0 499 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 HraslsQ9QZU4 167 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 ClcnkaQ9WUB7 687 aa11.19□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Glb1l3A2RSQ1 649 aa11.18□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 2610008E11RikG3X964 669 aa11.18□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Grcc10O35127 126 aa11.18□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cd40lgP27548 260 aa11.18□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Htr1bP28334 386 aa11.18□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nckap1P28660 1128 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 EpycP70186 322 aa11.18□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Col19a1Q0VF58 1136 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.5 ms