Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8H8

Alg8, Probable dolichyl pyrophosphate Glc1Man9GlcNAc2 alpha-1,3-glucosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg8Q6P8H8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Alg8Q6P8H8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Alg8Q6P8H8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Alg8Q6P8H8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Alg8Q6P8H8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Alg8Q6P8H8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Alg8Q6P8H8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Alg8Q6P8H8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Alg8Q6P8H8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Alg8Q6P8H8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Alg8Q6P8H8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Alg8Q6P8H8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Alg8Q6P8H8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Alg8Q6P8H8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alg8Q6P8H8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alg8Q6P8H8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Alg8Q6P8H8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Alg8Q6P8H8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Alg8Q6P8H8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Alg8Q6P8H8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Alg8Q6P8H8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Alg8Q6P8H8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Alg8Q6P8H8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Alg8Q6P8H8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Alg8Q6P8H8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Alg8Q6P8H8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Alg8Q6P8H8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Alg8Q6P8H8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Alg8Q6P8H8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Alg8Q6P8H8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Alg8Q6P8H8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Alg8Q6P8H8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alg8Q6P8H8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Alg8Q6P8H8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Alg8Q6P8H8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Alg8Q6P8H8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Alg8Q6P8H8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Alg8Q6P8H8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Alg8Q6P8H8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Alg8Q6P8H8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Alg8Q6P8H8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Alg8Q6P8H8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Alg8Q6P8H8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Alg8Q6P8H8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Alg8Q6P8H8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Alg8Q6P8H8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Alg8Q6P8H8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Alg8Q6P8H8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Alg8Q6P8H8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Alg8Q6P8H8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Alg8Q6P8H8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Alg8Q6P8H8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Alg8Q6P8H8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Alg8Q6P8H8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Alg8Q6P8H8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Alg8Q6P8H8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Alg8Q6P8H8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Alg8Q6P8H8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Alg8Q6P8H8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Alg8Q6P8H8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Alg8Q6P8H8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Alg8Q6P8H8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Alg8Q6P8H8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Alg8Q6P8H8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Alg8Q6P8H8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Alg8Q6P8H8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Alg8Q6P8H8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Alg8Q6P8H8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Alg8Q6P8H8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Alg8Q6P8H8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Alg8Q6P8H8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Alg8Q6P8H8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Alg8Q6P8H8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Alg8Q6P8H8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Alg8Q6P8H8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alg8Q6P8H8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Alg8Q6P8H8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alg8Q6P8H8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Alg8Q6P8H8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Alg8Q6P8H8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Alg8Q6P8H8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Alg8Q6P8H8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Alg8Q6P8H8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Alg8Q6P8H8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Alg8Q6P8H8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Alg8Q6P8H8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Alg8Q6P8H8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Alg8Q6P8H8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Alg8Q6P8H8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Alg8Q6P8H8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Alg8Q6P8H8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Alg8Q6P8H8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Alg8Q6P8H8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Alg8Q6P8H8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Alg8Q6P8H8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Alg8Q6P8H8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Alg8Q6P8H8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alg8Q6P8H8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alg8Q6P8H8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alg8Q6P8H8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms