Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Klhl22Q99JN2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Klhl22Q99JN2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Klhl22Q99JN2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Klhl22Q99JN2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Klhl22Q99JN2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Klhl22Q99JN2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Klhl22Q99JN2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Klhl22Q99JN2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Klhl22Q99JN2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Klhl22Q99JN2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Klhl22Q99JN2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klhl22Q99JN2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klhl22Q99JN2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Klhl22Q99JN2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Klhl22Q99JN2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Klhl22Q99JN2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Klhl22Q99JN2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Klhl22Q99JN2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Klhl22Q99JN2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klhl22Q99JN2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Klhl22Q99JN2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Klhl22Q99JN2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Klhl22Q99JN2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Klhl22Q99JN2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Klhl22Q99JN2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klhl22Q99JN2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klhl22Q99JN2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Klhl22Q99JN2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Klhl22Q99JN2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Klhl22Q99JN2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Klhl22Q99JN2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Klhl22Q99JN2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Klhl22Q99JN2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Klhl22Q99JN2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Klhl22Q99JN2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Klhl22Q99JN2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Klhl22Q99JN2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klhl22Q99JN2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klhl22Q99JN2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Klhl22Q99JN2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Klhl22Q99JN2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Klhl22Q99JN2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klhl22Q99JN2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl22Q99JN2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl22Q99JN2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klhl22Q99JN2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhl22Q99JN2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klhl22Q99JN2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl22Q99JN2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl22Q99JN2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl22Q99JN2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl22Q99JN2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl22Q99JN2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klhl22Q99JN2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl22Q99JN2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl22Q99JN2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl22Q99JN2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl22Q99JN2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klhl22Q99JN2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Klhl22Q99JN2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Klhl22Q99JN2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klhl22Q99JN2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhl22Q99JN2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhl22Q99JN2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl22Q99JN2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Klhl22Q99JN2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl22Q99JN2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl22Q99JN2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhl22Q99JN2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klhl22Q99JN2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhl22Q99JN2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhl22Q99JN2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhl22Q99JN2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhl22Q99JN2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhl22Q99JN2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhl22Q99JN2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhl22Q99JN2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhl22Q99JN2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhl22Q99JN2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl22Q99JN2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl22Q99JN2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhl22Q99JN2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhl22Q99JN2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhl22Q99JN2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klhl22Q99JN2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl22Q99JN2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhl22Q99JN2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhl22Q99JN2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhl22Q99JN2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klhl22Q99JN2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Klhl22Q99JN2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Klhl22Q99JN2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Klhl22Q99JN2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl22Q99JN2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl22Q99JN2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhl22Q99JN2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Klhl22Q99JN2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Klhl22Q99JN2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klhl22Q99JN2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms