Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44,28■■■■■ 4,68
Col19a1Q0VF58 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41,31■■■■■ 4,2
Col19a1Q0VF58 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Col19a1Q0VF58 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,77■■■■□ 3,8
Col19a1Q0VF58 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,97■■■■□ 3,67
Col19a1Q0VF58 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Col19a1Q0VF58 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Col19a1Q0VF58 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Col19a1Q0VF58 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Col19a1Q0VF58 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,03■■■■□ 3,52
Col19a1Q0VF58 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36,83■■■■□ 3,49
Col19a1Q0VF58 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,42■■■■□ 3,42
Col19a1Q0VF58 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,06■■■■□ 3,36
Col19a1Q0VF58 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Col19a1Q0VF58 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,01■■■■□ 3,36
Col19a1Q0VF58 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Col19a1Q0VF58 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Col19a1Q0VF58 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Col19a1Q0VF58 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,2■■■■□ 3,23
Col19a1Q0VF58 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,17■■■■□ 3,22
Col19a1Q0VF58 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Col19a1Q0VF58 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Col19a1Q0VF58 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Col19a1Q0VF58 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Col19a1Q0VF58 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Col19a1Q0VF58 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Col19a1Q0VF58 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Col19a1Q0VF58 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,05
Col19a1Q0VF58 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,01■■■■□ 3,03
Col19a1Q0VF58 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Col19a1Q0VF58 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Col19a1Q0VF58 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,79■■■■□ 3
Col19a1Q0VF58 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Col19a1Q0VF58 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Col19a1Q0VF58 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,53■■■□□ 2,96
Col19a1Q0VF58 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,51■■■□□ 2,95
Col19a1Q0VF58 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,48■■■□□ 2,95
Col19a1Q0VF58 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Col19a1Q0VF58 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Col19a1Q0VF58 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,45■■■□□ 2,95
Col19a1Q0VF58 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,45■■■□□ 2,95
Col19a1Q0VF58 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Col19a1Q0VF58 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Col19a1Q0VF58 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
Col19a1Q0VF58 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,25■■■□□ 2,91
Col19a1Q0VF58 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Col19a1Q0VF58 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Col19a1Q0VF58 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Col19a1Q0VF58 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,13■■■□□ 2,89
Col19a1Q0VF58 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Col19a1Q0VF58 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,02■■■□□ 2,88
Col19a1Q0VF58 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Col19a1Q0VF58 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,98■■■□□ 2,87
Col19a1Q0VF58 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Col19a1Q0VF58 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Col19a1Q0VF58 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,67■■■□□ 2,82
Col19a1Q0VF58 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Col19a1Q0VF58 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Col19a1Q0VF58 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Col19a1Q0VF58 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Col19a1Q0VF58 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32,46■■■□□ 2,79
Col19a1Q0VF58 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Col19a1Q0VF58 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Col19a1Q0VF58 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Col19a1Q0VF58 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Col19a1Q0VF58 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Col19a1Q0VF58 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Col19a1Q0VF58 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Col19a1Q0VF58 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,1■■■□□ 2,73
Col19a1Q0VF58 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Col19a1Q0VF58 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Col19a1Q0VF58 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32,06■■■□□ 2,72
Col19a1Q0VF58 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Col19a1Q0VF58 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32,02■■■□□ 2,72
Col19a1Q0VF58 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Col19a1Q0VF58 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,89■■■□□ 2,7
Col19a1Q0VF58 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Col19a1Q0VF58 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Col19a1Q0VF58 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,7■■■□□ 2,67
Col19a1Q0VF58 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Col19a1Q0VF58 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Col19a1Q0VF58 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Col19a1Q0VF58 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31,62■■■□□ 2,65
Col19a1Q0VF58 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Col19a1Q0VF58 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Col19a1Q0VF58 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Col19a1Q0VF58 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Col19a1Q0VF58 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Col19a1Q0VF58 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Col19a1Q0VF58 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Col19a1Q0VF58 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Col19a1Q0VF58 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31,46■■■□□ 2,63
Col19a1Q0VF58 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Col19a1Q0VF58 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Col19a1Q0VF58 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Col19a1Q0VF58 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Col19a1Q0VF58 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,42■■■□□ 2,62
Col19a1Q0VF58 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Col19a1Q0VF58 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Col19a1Q0VF58 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31,32■■■□□ 2,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms