Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS2

Tprg1l, Tumor protein p63-regulated gene 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tprg1lQ9DBS2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Tprg1lQ9DBS2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tprg1lQ9DBS2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tprg1lQ9DBS2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tprg1lQ9DBS2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tprg1lQ9DBS2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tprg1lQ9DBS2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tprg1lQ9DBS2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Tprg1lQ9DBS2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tprg1lQ9DBS2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Tprg1lQ9DBS2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tprg1lQ9DBS2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Tprg1lQ9DBS2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tprg1lQ9DBS2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tprg1lQ9DBS2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tprg1lQ9DBS2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Tprg1lQ9DBS2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tprg1lQ9DBS2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tprg1lQ9DBS2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tprg1lQ9DBS2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tprg1lQ9DBS2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tprg1lQ9DBS2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tprg1lQ9DBS2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tprg1lQ9DBS2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tprg1lQ9DBS2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tprg1lQ9DBS2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tprg1lQ9DBS2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tprg1lQ9DBS2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tprg1lQ9DBS2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tprg1lQ9DBS2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tprg1lQ9DBS2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tprg1lQ9DBS2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tprg1lQ9DBS2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tprg1lQ9DBS2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tprg1lQ9DBS2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tprg1lQ9DBS2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tprg1lQ9DBS2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tprg1lQ9DBS2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Tprg1lQ9DBS2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tprg1lQ9DBS2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tprg1lQ9DBS2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tprg1lQ9DBS2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tprg1lQ9DBS2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tprg1lQ9DBS2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tprg1lQ9DBS2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tprg1lQ9DBS2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tprg1lQ9DBS2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tprg1lQ9DBS2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tprg1lQ9DBS2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tprg1lQ9DBS2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tprg1lQ9DBS2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tprg1lQ9DBS2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tprg1lQ9DBS2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tprg1lQ9DBS2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tprg1lQ9DBS2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tprg1lQ9DBS2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tprg1lQ9DBS2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tprg1lQ9DBS2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tprg1lQ9DBS2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tprg1lQ9DBS2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tprg1lQ9DBS2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tprg1lQ9DBS2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tprg1lQ9DBS2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tprg1lQ9DBS2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tprg1lQ9DBS2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tprg1lQ9DBS2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tprg1lQ9DBS2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tprg1lQ9DBS2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tprg1lQ9DBS2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tprg1lQ9DBS2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tprg1lQ9DBS2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tprg1lQ9DBS2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tprg1lQ9DBS2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tprg1lQ9DBS2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tprg1lQ9DBS2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tprg1lQ9DBS2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tprg1lQ9DBS2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tprg1lQ9DBS2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tprg1lQ9DBS2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tprg1lQ9DBS2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tprg1lQ9DBS2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tprg1lQ9DBS2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tprg1lQ9DBS2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tprg1lQ9DBS2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tprg1lQ9DBS2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tprg1lQ9DBS2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tprg1lQ9DBS2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tprg1lQ9DBS2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tprg1lQ9DBS2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tprg1lQ9DBS2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tprg1lQ9DBS2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tprg1lQ9DBS2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tprg1lQ9DBS2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tprg1lQ9DBS2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tprg1lQ9DBS2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tprg1lQ9DBS2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tprg1lQ9DBS2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tprg1lQ9DBS2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tprg1lQ9DBS2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tprg1lQ9DBS2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.1 ms