RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 CMPK1P30085 196 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 CHRNB4P30926 498 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 COILP38432 576 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 MEOX1P50221 254 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 ITGA8P53708 1063 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 GPR85P60893 370 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 ADAM8P78325 824 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 IKZF1Q13422 519 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 ABRAXAS2Q15018 415 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 TMED2Q15363 201 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 MAPKAPK3Q16644 382 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 MEP1AQ16819 746 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 PARP6Q2NL67 630 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 MFSD4BQ5TF39 518 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 CCDC181Q5TID7 509 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 GARNL3Q5VVW2 1013 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 SLC25A25Q6KCM7 469 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 CTAGE6Q86UF2 777 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 LIX1LQ8IVB5 337 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 TRIM58Q8NG06 486 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 OR6P1Q8NGX9 317 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 OR51Q1Q8NH59 317 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 LILRB4Q8NHJ6 448 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 ELP5Q8TE02 316 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 ZNF480Q8WV37 535 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 PWWP2AQ96N64 755 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 OLFM1Q99784 485 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 ZNF559Q9BR84 538 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 CDCP1Q9H5V8 836 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 TREX1Q9NSU2 369 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 DEPPQ9NTK1 212 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 TEKT2Q9UIF3 430 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 CDC14AQ9UNH5 594 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 MED16Q9Y2X0 877 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.4□□□□□ -1.22
RD3L-201ENST00000557640 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.4□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 COL6A5A8TX70 2615 aa7.4□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 E7ENX8 843 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 GOLGA8TH3BQL2 631 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 TFECO14948 347 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 PROM1O43490 865 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 KLK8O60259 260 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 VPS26AO75436 327 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 CTAG2O75638 210 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 SUN1O94901 812 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 ETS1P14921 441 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 TFEBP19484 476 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 NMBRP28336 390 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 PTGS2P35354 604 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 BCL6P41182 706 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 OLR1P78380 273 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 TAP2Q03519 686 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 LTBQ06643 244 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 MYBPHQ13203 477 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 FAM53BQ14153 422 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 RTL6Q6ICC9 239 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 MDGA2Q7Z553 956 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 KCT2Q8NC54 265 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 M1APQ8TC57 530 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 SMPDL3AQ92484 453 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 LPGAT1Q92604 370 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 SLCO2A1Q92959 643 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 PEX11GQ96HA9 241 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 ABCF3Q9NUQ8 709 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 RIMKLBQ9ULI2 386 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 SNX12Q9UMY4 172 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 JRKLQ9Y4A0 524 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 DOCK7Q96N67 2140 aa7.39□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 ATRQ13535 2644 aa7.38□□□□□ -1.23
RD3L-201ENST00000557640 ANK2Q01484 3957 aa7.38□□□□□ -1.23
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