RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556321.1

PSMA3-210, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-210	ENST00000556321	BICD1	Q96G01	975 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	NDN	Q99608	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	WNT16	Q9UBV4	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	TTC3	P53804	2025 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	EVPL	Q92817	2033 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ABCC4	O15439	1325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	IL16	Q14005	1332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321		A0A1W2PPI3	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	CFAP73	A6NFT4	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	BBOX1	O75936	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	GHR	P10912	638 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	FER	P16591	822 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	UGT1A6	P19224	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	DGKA	P23743	735 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	KCNJ4	P48050	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC26A5	P58743	744 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	GMFB	P60983	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	GCNT1	Q02742	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	CETN1	Q12798	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	TAF10	Q12962	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	FUT10	Q6P4F1	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	HSD17B8	Q92506	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	MYH3	P11055	1940 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	UBE4B	O95155	1302 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC28A1	O00337	649 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ACSL4	O60488	711 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	FSHB	P01225	129 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	PGK2	P07205	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	PRSS2	P07478	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	CDH1	P12830	882 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	CCND2	P30279	289 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SSTR1	P30872	391 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	LCP2	Q13094	533 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ETFDH	Q16134	617 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	PLD3	Q8IV08	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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