RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 MAB21L2Q9Y586 359 aa16.97■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa16.96■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa16.96■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 HCN1O60741 890 aa16.96■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 RHOBTB1O94844 696 aa16.96■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 LMO2P25791 158 aa16.96■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF81P51508 661 aa16.96■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 DDI2Q5TDH0 399 aa16.96■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa16.96■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 Q8N402 240 aa16.96■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 OR8D4Q8NGM9 314 aa16.96■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 MSLNLQ96KJ4 702 aa16.96■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 SDHAF3Q9NRP4 125 aa16.96■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 CTSFQ9UBX1 484 aa16.96■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 FBXW11Q9UKB1 542 aa16.96■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 PITPNM1O00562 1244 aa16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 GATCO43716 136 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 ESR1P03372 595 aa16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 GABRB1P18505 474 aa16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 LHCGRP22888 699 aa16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 CRYBB2P43320 205 aa16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 JAZF1Q86VZ6 243 aa16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 DENND1CQ8IV53 801 aa16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 PGBD3Q8N328 593 aa16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 SLC25A46Q96AG3 418 aa16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 DPY30Q9C005 99 aa16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 MCOLN1Q9GZU1 580 aa16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF222Q9UK12 451 aa16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 DUSP12Q9UNI6 340 aa16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 KCTD3Q9Y597 815 aa16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 OR6C65A6NJZ3 312 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 AP2A2O94973 939 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 SCG5P05408 212 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 PAQR3Q6TCH7 311 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 FAM92BQ6ZTR7 304 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 LIX1Q8N485 282 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 OR5T2Q8NGG2 359 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 SIK2Q9H0K1 926 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 IMPAD1Q9NX62 359 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 SLC6A14Q9UN76 642 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 SMIM30A4D0T7 59 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 SH3D21A4FU49 640 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 A8MXK9 166 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 HAS3O00219 553 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 SIGLEC6O43699 453 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 SUOXP51687 545 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 AIF1P55008 147 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 ITGA1P56199 1179 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 HSF2Q03933 536 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 MILR1Q7Z6M3 343 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 UNC93AQ86WB7 457 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 LRRC17Q8N6Y2 441 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM145Q8NBT3 493 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 ATG4CQ96DT6 458 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 HSH2DQ96JZ2 352 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 SLC2A13Q96QE2 648 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 DDIT4Q9NX09 232 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 MGAT4BQ9UQ53 548 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 FAM50BQ9Y247 325 aa16.95■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 LGALS8O00214 317 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 ECDO95905 644 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 HLA-DQB1P01920 261 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 JUPP14923 745 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 SGCAQ16586 387 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 KLHL22Q53GT1 634 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 DENND6BQ8NEG7 585 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 PPP1R16BQ96T49 567 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 MED28Q9H204 178 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 KCTD5Q9NXV2 234 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 SEC14L4Q9UDX3 406 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 EDARQ9UNE0 448 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 TUBAL3A6NHL2 446 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 CBX7O95931 251 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 SEMG1P04279 462 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 IL6P05231 212 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 ICAM3P32942 547 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 ABRAXAS2Q15018 415 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 SNAPC1Q16533 368 aa16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
GLIS1-202ENST00000628545 FEVQ99581 238 aa16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms