RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612086.1

5S_rRNA.23-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 102 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ITGAXP20702 1163 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CD82P27701 267 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 GSTM2P28161 218 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ARRB2P32121 409 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 STAT5AP42229 794 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 NAA20P61599 178 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SKP1P63208 163 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 HMGCS1Q01581 520 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 BST1Q10588 318 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CLN3Q13286 438 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 DNASE1L3Q13609 305 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PWP1Q13610 501 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 HERC3Q15034 1050 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 NR6A1Q15406 480 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 GALNTL6Q49A17 601 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CES4AQ5XG92 561 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ATG16L1Q676U5 607 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CHSY3Q70JA7 882 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PDSS2Q86YH6 399 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 FAM47BQ8NA70 645 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 OR2L5Q8NG80 312 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 WDR20Q8TBZ3 569 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 NKD1Q969G9 470 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 MS4A6EQ96DS6 147 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PEX11GQ96HA9 241 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 GBP5Q96PP8 586 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 TRMOQ9BU70 441 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 EBPLQ9BY08 206 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 AICDAQ9GZX7 198 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 NT5DC2Q9H857 520 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 MED4Q9NPJ6 270 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PADI1Q9ULC6 663 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CROCCQ5TZA2 2017 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 LRIT2A6NDA9 550 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PLPP1O14494 284 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PIP5K1BO14986 540 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 FOXS1O43638 330 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 B3GALT2O43825 422 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 B4GALT2O60909 372 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 JRKO75564 520 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 NSA2O95478 260 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 LINC00032P0C843 101 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 UROSP10746 265 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 GRK2P25098 689 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SERPINB1P30740 379 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 OTX2P32243 289 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 RORAP35398 523 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 FOLR3P41439 243 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PIK3CBP42338 1070 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CASP2P42575 452 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 XCR1P46094 333 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 MTTPP55157 894 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 RELAQ04206 551 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 OCA2Q04671 838 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 HYAL2Q12891 473 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 DSG2Q14126 1118 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ERV3-1Q14264 604 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 NCF4Q15080 339 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 BROXQ5VW32 411 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 KANK2Q63ZY3 851 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CYP20A1Q6UW02 462 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms