RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GVT2 93 aa20.64■□□□□ 0.89
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PTPRM-211ENST00000580170 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 PM20D2Q8IYS1 436 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
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PTPRM-211ENST00000580170 S100A10P60903 97 aa20.62■□□□□ 0.89
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PTPRM-211ENST00000580170 SEC61A2Q9H9S3 476 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 CD93Q9NPY3 652 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 SNAP29O95721 258 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 IFNA21P01568 189 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 CSF2P04141 144 aa20.61■□□□□ 0.89
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