RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534284.1

CYCSP28-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP28, Length 321 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP28-201ENST00000534284 ACVR1CQ8NER5 493 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 TRPV3Q8NET8 790 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 OR13J1Q8NGT2 312 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 OR4L1Q8NH43 312 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 TWIST2Q8WVJ9 160 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 XAGE5Q8WWM1 108 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 OVCA2Q8WZ82 227 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CASP10Q92851 521 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 TUBGCP3Q96CW5 907 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SPATA17Q96L03 361 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 TRIB3Q96RU7 358 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF382Q96SR6 550 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 BCL7BQ9BQE9 202 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 TMEM79Q9BSE2 394 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CXCL16Q9H2A7 254 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ALG9Q9H6U8 611 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 COQ10BQ9H8M1 238 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PLGRKTQ9HBL7 147 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 NT5MQ9NPB1 228 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 UBAP1Q9NZ09 502 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CCDC167Q9P0B6 97 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ANAPC2Q9UJX6 822 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 APPL1Q9UKG1 709 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 BLOC1S6Q9UL45 172 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CDH7Q9ULB5 785 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 DOCK4Q8N1I0 1966 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PLXNA3P51805 1871 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 GLTPD2A6NH11 291 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SUPT3HB4E1H0 165 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 F5H5T6 163 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 H7C0S8 307 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 NR5A2O00482 541 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 AP3D1O14617 1153 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 LDB2O43679 373 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 KLK8O60259 260 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SUPT3HO75486 399 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 NDUFS3O75489 264 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CLDN11O75508 207 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC22A3O75751 556 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 RHOBTB1O94844 696 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CDK14O94921 469 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PGM3O95394 542 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 LATS1O95835 1130 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 TSPAN15O95858 294 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 IGLV3-27P01718 113 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ELANEP08246 267 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PRR35P0CG20 571 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PEPDP12955 493 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ATP6V1B1P15313 513 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF12P17014 697 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ALOX12P18054 663 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 IL1RNP18510 177 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 GATA3P23771 443 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 YWHAQP27348 245 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 HMOX2P30519 316 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CNR2P34972 360 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 RFC2P35250 354 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ARL3P36405 182 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 LIPAP38571 399 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CAPGP40121 348 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 GRIA3P42263 894 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 DPP6P42658 865 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PTGER3P43115 390 aa4.55□□□□□ -1.68
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CYCSP28-201ENST00000534284 RGS4P49798 205 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ERFP50548 548 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CCT8P50990 548 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CDH4P55283 916 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 C1QTNF8P60827 252 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 HPCAP84074 193 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CDKL1Q00532 357 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 MGAT3Q09327 533 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 MERTKQ12866 999 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 LPIN1Q14693 890 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SEC23BQ15437 767 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 AAK1Q2M2I8 961 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 MYLK3Q32MK0 819 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 UGT3A2Q3SY77 523 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 C5orf22Q49AR2 442 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa4.55□□□□□ -1.68
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