RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SRPK3Q9UPE1 567 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 MAPRE3Q9UPY8 281 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CLCA2Q9UQC9 943 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CCL27Q9Y4X3 112 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PCM1Q15154 2024 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 CCDC187A0A096LP49 1063 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA8OA6NCC3 632 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 A8MU76 341 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA8NF8WBI6 632 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 LSM1O15116 133 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 BRINP1O60477 761 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SNX3O60493 162 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 MYO1DO94832 1006 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 LINC00032P0C843 101 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PRR35P0CG20 571 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 FGF5P12034 268 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 LBPP18428 481 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 IDH3AP50213 366 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 HTR6P50406 440 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 NEK2P51955 445 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 RAP1GDS1P52306 607 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ARFIP2P53365 341 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ITGA1P56199 1179 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 RPS13P62277 151 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 MC2RQ01718 297 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 EMX2Q04743 252 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ACSM2AQ08AH3 577 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TUBB3Q13509 450 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 HERC3Q15034 1050 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 NR6A1Q15406 480 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 MUM1Q2TAK8 710 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PRTGQ2VWP7 1150 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SGO1Q5FBB7 561 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 WASHC2DQ5SRD0 308 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ACSM2BQ68CK6 577 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 FRMPD2BQ6IN97 320 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 GALNT18Q6P9A2 607 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TRIM40Q6P9F5 258 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PCSK4Q6UW60 755 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZSR9 355 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 VN1R5Q7Z5H4 357 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ZFAND4Q86XD8 727 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PLD3Q8IV08 490 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 METTL4Q8N3J2 472 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 CSNK1A1LQ8N752 337 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ANKS4BQ8N8V4 417 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 CHTF18Q8WVB6 975 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 FGF11Q92914 225 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TUBGCP3Q96CW5 907 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 KCNC2Q96PR1 638 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 CCT8L2Q96SF2 557 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ACPTQ9BZG2 426 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 NRSN2Q9GZP1 204 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 KLHL25Q9H0H3 589 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 LRTM1Q9HBL6 345 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TCF7L2Q9NQB0 619 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TMEM45AQ9NWC5 275 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 RARRES3Q9UL19 164 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SLC12A4Q9UP95 1085 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD12Q6UB98 2062 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SDHDO14521 159 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 DIAPH2O60879 1101 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 GUCY1B2O75343 617 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SEC22BO75396 215 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 OR2B3O76000 313 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SCELO95171 688 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TGFB1P01137 390 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SERPIND1P05546 499 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SMIM10L1P0DMW3 83 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PRPS2P11908 318 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 FOLR1P15328 257 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PDX1P52945 283 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ERVK-8P63133 956 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TLE3Q04726 772 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 RTP5Q14D33 572 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 AP5B1Q2VPB7 878 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.2 ms