RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 IDSP22304 550 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 GPX3P22352 226 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 ACRV1P26436 265 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 MSX1P28360 303 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 NSG1P42857 185 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 CLCN7P51798 805 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 CLCNKAP51800 687 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 CDH13P55290 713 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 KCNK10P57789 538 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 MC2RQ01718 297 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 NFATC3Q12968 1075 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 SQSTM1Q13501 440 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 MED21Q13503 144 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 KIR2DS5Q14953 304 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 TRIP10Q15642 601 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 RPE65Q16518 533 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 RBBP7Q16576 425 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 COLEC12Q5KU26 742 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 DCAF12Q5T6F0 453 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 DTX1Q86Y01 620 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 PDSS2Q86YH6 399 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 BMPERQ8N8U9 685 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 MOCOSQ96EN8 888 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 VPS35Q96QK1 796 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 UCN2Q96RP3 112 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 NPAS2Q99743 824 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 ACSS2Q9NR19 701 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 ADA2Q9NZK5 511 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 POLG2Q9UHN1 485 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 OARD1Q9Y530 152 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 SEC16AO15027 2179 aa6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 LILRA5A6NI73 299 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 PRR19A6NJB7 356 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 AQP12BA6NM10 295 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 OR5K4A6NMS3 321 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 AGAP14A8MT82 685 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 B4E171 279 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 H3BNX3 289 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 CDC7O00311 574 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 E2F3O00716 465 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 ACOT8O14734 319 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 NKX2-8O15522 239 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 OR1I1O60431 355 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 KATNA1O75449 491 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 C8BP07358 591 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 OR56A5P0C7T3 313 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 UQCRBP14927 111 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 VCLP18206 1134 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 CALRP27797 417 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 TSPAN7P41732 249 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 EPHA4P54764 986 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 ERVK-8P63133 956 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 CDKL1Q00532 357 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 CEACAM7Q14002 265 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 MAP7Q14244 749 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 KCNAB1Q14722 419 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 PLCL1Q15111 1095 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 PPP1R3AQ16821 1122 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 XKR7Q5GH72 579 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 LDLRAP1Q5SW96 308 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 CACHD1Q5VU97 1274 aa6□□□□□ -1.45
MITF-215ENST00000478490 CEACAM20Q6UY09 585 aa6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms