RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504263.1

PCAT4-201, prostate cancer associated transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT4, Length 2,091 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT4-201ENST00000504263 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CNTN6Q9UQ52 1028 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CRYL1Q9Y2S2 319 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ASB1Q9Y576 335 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ORC6Q9Y5N6 252 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 NPTNQ9Y639 398 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ARID2Q68CP9 1835 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 FAM221BA6H8Z2 402 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 C5orf52A6NGY3 159 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ANKDD1BA6NHY2 528 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 A8MVJ9 347 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PDCD5O14737 125 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CASC3O15234 703 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 TGM5O43548 720 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 XPNPEP2O43895 674 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PCDHGA12O60330 932 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 TPST1O60507 370 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 POP7O75817 140 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 LSM8O95777 96 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 NDUFB10O96000 172 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 RLN2P04090 185 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 FCER2P06734 321 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CHRNGP07510 517 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 NMBP08949 121 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 COX5BP10606 129 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 G6PDP11413 515 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 TNNI1P19237 187 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PAICSP22234 425 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 NOS3P29474 1203 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 GRK4P32298 578 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 HSPA7P48741 367 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PXNP49023 591 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 RGS6P49758 472 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 LIG4P49917 911 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 LIMK2P53671 638 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CD81P60033 236 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PSMC6P62333 389 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ABATP80404 500 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 E2F1Q01094 437 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 DEFA6Q01524 100 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CHRNB3Q05901 458 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF33AQ06730 810 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ECH1Q13011 328 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 RPA4Q13156 261 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CAMK2DQ13557 499 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 DGCR6Q14129 220 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 TFDP2Q14188 446 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CHRNA6Q15825 494 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SSX2Q16385 188 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 HADHQ16836 314 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 TRIM60Q495X7 471 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 FLYWCH1Q4VC44 716 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PYCR3Q53H96 274 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CCDC157Q569K6 752 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 FBXO48Q5FWF7 155 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 THEM4Q5T1C6 240 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 FAM171A1Q5VUB5 890 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 LIN54Q6MZP7 749 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 FAM92BQ6ZTR7 304 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 C1orf186Q6ZWK4 172 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF534Q76KX8 674 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SLC26A9Q7LBE3 791 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SSX9Q7RTT3 188 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 MILR1Q7Z6M3 343 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 TAC4Q86UU9 113 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 COMTD1Q86VU5 262 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 METTL23Q86XA0 190 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ADHFE1Q8IWW8 467 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CLDN22Q8N7P3 220 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SLC44A5Q8NCS7 719 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF540Q8NDQ6 660 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 TRPV1Q8NER1 839 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 IFI44Q8TCB0 444 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 METTL6Q8TCB7 284 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CHURC1Q8WUH1 139 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SDR42E1Q8WUS8 393 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 UCN3Q969E3 161 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SLC22A18Q96BI1 424 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 COA7Q96BR5 231 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PYCR2Q96C36 320 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.39□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 COQ8BQ96D53 544 aa3.39□□□□□ -1.87
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