RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460168.1

HERC4-207, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HERC4, Length 2,215 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-207ENST00000460168 TM7SF3Q9NS93 570 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 ANKMY1Q9P2S6 941 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 A0A0G2JPF8 293 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 CCDC160A6NGH7 325 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 TOR1AO14656 332 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 UBDO15205 165 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 C7P10643 843 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 PTPN4P29074 926 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 PHC1P78364 1004 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 TRAF3Q13114 568 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 DUSP7Q16829 419 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 SYT13Q7L8C5 426 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 SYNPOQ8N3V7 929 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 FAM109AQ8N4B1 249 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 POU5F2Q8N7G0 328 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 SNX31Q8N9S9 440 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 ZFP28Q8NHY6 868 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 TUBGCP3Q96CW5 907 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 CMTM5Q96DZ9 223 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 APOOQ9BUR5 198 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 TUBB1Q9H4B7 451 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 SGK2Q9HBY8 427 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 VCANP13611 3396 aa10□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 PTP4A3O75365 173 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 CCNDBP1O95273 360 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 C1orf105O95561 183 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 SEMA4FO95754 770 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 SLC16A8O95907 504 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 SMIM18P0DKX4 95 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 HGFP14210 728 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 JAK1P23458 1154 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 ITPKAP23677 461 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 KLF10Q13118 480 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 RPA4Q13156 261 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 SELENBP1Q13228 472 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 TRIM69Q86WT6 500 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 RASGRP3Q8IV61 690 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 ADHFE1Q8IWW8 467 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 KBTBD2Q8IY47 623 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 HPS1Q92902 700 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 TP53INP1Q96A56 240 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 FBXL8Q96CD0 374 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 MED8Q96G25 268 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 SHDQ96IW2 340 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 ACTR8Q9H981 624 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 ITM2CQ9NQX7 267 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 SLC23A2Q9UGH3 650 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 EBF1Q9UH73 591 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 SLC22A14Q9Y267 594 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 ASF1AQ9Y294 204 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 LOC100653049A0A140TA62 436 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 POM121BA6NF01 834 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 FPGTO14772 594 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 GYG2O15488 501 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 KRT34O76011 436 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 EBLN1P0CF75 366 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 ACP5P13686 325 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 RPL10P27635 214 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 TALDO1P37837 337 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 SLC6A12P48065 614 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 CLDN2P57739 230 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 MAPKAPK3Q16644 382 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 SCIMPQ6UWF3 145 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 OXR1Q8N573 874 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 CAMKK1Q8N5S9 505 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 TSTD1Q8NFU3 115 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 ASB12Q8WXK4 309 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 PHF12Q96QT6 1004 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 HBEGFQ99075 208 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 NTMT1Q9BV86 223 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC4-207ENST00000460168 MVB12BQ9H7P6 319 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms