RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 NMBRP28336 390 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 PPIAP62937 165 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 OLR1P78380 273 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 BTG2P78543 158 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 CRADDP78560 199 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 PCID2Q5JVF3 399 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 PAMR1Q6UXH9 720 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 ASPGQ86U10 573 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 REXO1L1PQ8IX06 675 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 MPP5Q8N3R9 675 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 SLC13A3Q8WWT9 602 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D20Q96BZ9 403 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 THAP11Q96EK4 314 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 PTCHD1Q96NR3 888 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 DMRT3Q9NQL9 472 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 SH2B3Q9UQQ2 575 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 CRYL1Q9Y2S2 319 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 LIPGQ9Y5X9 500 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 SLC22A7Q9Y694 548 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 FN1P02751 2386 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 A6NNC1 897 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 E7EVH7 732 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 B3GALT4O96024 378 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 IMPA1P29218 277 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 HOXC12P31275 282 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 PRUNE1Q86TP1 453 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 VSTM4Q8IW00 320 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM156Q8N614 296 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 OTUD6BQ8N6M0 293 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 SLC30A3Q99726 388 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 KCMF1Q9P0J7 381 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA8KD6RF30 607 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA8TH3BQL2 631 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 CHST10O43529 356 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 ITGA10O75578 1167 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 ATE1O95260 518 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 RAF1P04049 648 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 PTMAP06454 111 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 HEXAP06865 529 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 HRH2P25021 359 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 ARNTP27540 789 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 FDFT1P37268 417 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 PLGLB1Q02325 96 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 CHSY3Q70JA7 882 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 SMC6Q96SB8 1091 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 CBLCQ9ULV8 474 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 FIGNL2A6NMB9 653 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 H3BMM5 538 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 BCKDKO14874 412 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ESR1P03372 595 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 MAOAP21397 527 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 HYAL2Q12891 473 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 CES3Q6UWW8 571 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 APCDD1LQ8NCL9 501 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 CREB3L4Q8TEY5 395 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 NUDT8Q8WV74 236 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ATG4AQ8WYN0 398 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 SLCO2A1Q92959 643 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 NECTIN3Q9NQS3 549 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 RAB6BQ9NRW1 208 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 FBXW2Q9UKT8 454 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 OR14I1A6ND48 311 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 TUBB4AP04350 444 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ETS1P14921 441 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 JAK1P23458 1154 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 UQCRC1P31930 480 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 TBPL1P62380 186 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 KEAP1Q14145 624 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 RPS6KA1Q15418 735 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB134Q4QY38 66 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 FLYWCH1Q4VC44 716 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 CYHR1Q6ZMK1 362 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 QSOX2Q6ZRP7 698 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA0408Q6ZU52 694 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 PSD4Q8NDX1 1056 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF740Q8NDX6 193 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 OR2M7Q8NG81 312 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ASB11Q8WXH4 323 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 PANX2Q96RD6 677 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms