RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295987.12

SYN1-201, Transcript of synapsin I, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SYN1, Length 3,299 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1-201ENST00000295987 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.91□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.91□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.91□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 A6NL46 340 aa14.91□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 HOXA2O43364 376 aa14.91□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 PRKAG1P54619 331 aa14.91□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 KDM4DQ6B0I6 523 aa14.91□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.91□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 ZNF605Q86T29 641 aa14.91□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.91□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.91□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 ABCG4Q9H172 646 aa14.91□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.91□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 TYRP14679 529 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 RGNQ15493 299 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 ZNF284Q2VY69 593 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 CENPOQ9BU64 300 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 H3BM21 787 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 H3BN98 237 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 POP4O95707 220 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 PTHP01270 115 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 C8GP07360 202 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 CCDC159P0C7I6 412 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 SERPINB1P30740 379 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 CRYBA2P53672 197 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 ST3GAL4Q11206 333 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 TEAD2Q15562 447 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 TRIM60Q495X7 471 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 TMEM203Q969S6 136 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 WASH3PC4AMC7 463 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 WWP2O00308 870 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 SLC16A6O15403 523 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 LATO43561 262 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 JRKO75564 520 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 CXCL14O95715 111 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 C9P02748 559 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 SPNP16150 400 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 HSPB3Q12988 150 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 RFX4Q33E94 735 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 OR8H2Q8N162 312 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 VPS35Q96QK1 796 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 OR5M11Q96RB7 305 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.9□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 PTPRSQ13332 1948 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 EYSQ5T1H1 3165 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 GLOD5A6NK44 160 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 SSX4O60224 188 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 ELFN1P0C7U0 828 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 IMPDH2P12268 514 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 MESP2Q0VG99 397 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 DEF8Q6ZN54 512 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 C7orf57Q8NEG2 295 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 APH1BQ8WW43 257 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 DSN1Q9H410 356 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 CATP04040 527 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 RYKP34925 604 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 NR4A2P43354 598 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 SCARB2Q14108 478 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 GBF1Q92538 1859 aa14.89□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 PSMD11O00231 422 aa14.88□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 KIAA0355O15063 1070 aa14.88□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 LRRTM2O43300 516 aa14.88□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 SOCS5O75159 536 aa14.88□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 CD9P21926 228 aa14.88□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 SLC6A12P48065 614 aa14.88□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 TAB1Q15750 504 aa14.88□□□□□ -0.03
SYN1-201ENST00000295987 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms