RNA–Protein interactions for RNA: YKR085C

MRPL20, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL20, Length 588 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL20	YKR085C	HEH2	Q03281	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL20	YKR085C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	YUR1	P26725	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	URK1	P27515	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	HXT5	P38695	592 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	BRL1	P38770	471 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	LCD1	Q04377	747 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	ISF1	P32488	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	RAD24	P32641	659 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	INP52	P50942	1183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	MCM16	Q12262	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	PIF1	P07271	859 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	RAD18	P10862	487 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	PRE8	P23639	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	PPZ1	P26570	692 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	SYN8	P31377	255 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	DUR3	P33413	735 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	HUL4	P40985	892 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	AZR1	P50080	613 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	YNL193W	P53870	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	TRM11	Q12463	433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	RKM4	Q12504	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	TEL1	P38110	2787 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	SNA3	P14359	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	SRM1	P21827	482 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	TFC4	P33339	1025 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	SHP1	P34223	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	SPO74	P45819	413 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	SCS3	P53012	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	MET13	P53128	600 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	SOL4	P53315	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	CYB2	P00175	591 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	MAS2	P11914	482 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	TIM23	P32897	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	IRC24	P40580	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	POL32	P47110	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
MRPL20	YKR085C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	LAM4	P38800	1345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	GRX7	P38068	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	POA1	P38218	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	YTA12	P40341	825 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	YNL034W	P53963	612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	YNL018C	P53976	612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	SKY1	Q03656	742 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	HDA3	Q06623	655 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	IRC10	Q08118	586 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	ERP3	Q12403	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL20	YKR085C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	FLR1	P38124	548 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	REG2	P38232	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	MSC2	Q03455	724 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	MYO1	P08964	1928 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	PRC1	P00729	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	POL3	P15436	1097 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	SEC8	P32855	1065 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	TVP23	P38962	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	BET2	P20133	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	ACE2	P21192	770 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	FUB1	P25659	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	SOH1	P38633	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	PNG1	Q02890	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	YMR321C	Q04898	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	CHS3	P29465	1165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	OMA1	P36163	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	BUD9	P53226	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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