RNA–Protein interactions for RNA: YJL007C

YJL007C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL007C, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL007C	YJL007C	LST4	P34239	828 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJL007C	YJL007C	HFM1	P51979	1187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJL007C	YJL007C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YJL007C	YJL007C	TYW3	P53177	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJL007C	YJL007C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YJL007C	YJL007C	EEB1	Q02891	456 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJL007C	YJL007C	ATG13	Q06628	738 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJL007C	YJL007C	INO1	P11986	533 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	CDC34	P14682	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	SLA2	P33338	968 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	PNT1	P38969	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	GEM1	P39722	662 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	RMD1	Q03441	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	MSC2	Q03455	724 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	YAP6	Q03935	383 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	EMC1	P25574	760 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	YGL176C	P46945	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	ASF1	P32447	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	XYL2	Q07993	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	ENA1	P13587	1091 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	VPS62	P53285	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	ESC2	Q06340	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	YKL107W	P34251	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	RRT14	P40470	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	PHO23	P50947	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	MTC3	P53077	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	HMI1	Q12039	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	PNS1	Q12412	539 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	HCM1	P25364	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	TRM2	P33753	639 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	MND2	P40577	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	TPO1	Q07824	586 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	RKM4	Q12504	494 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL007C	YJL007C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	YKL151C	P36059	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	PLB1	P39105	664 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	MET10	P39692	1035 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	OSW2	Q12202	724 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	POA1	P38218	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	SUN4	P53616	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	SPO20	Q04359	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	STE11	P23561	717 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	MNR2	P35724	969 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	PUS9	Q12069	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	MSE1	P48525	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	YGR053C	P53234	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	NTO1	Q12311	748 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	YAP1801	P38856	637 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	MBP1	P39678	833 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	MET12	P46151	657 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	ADY3	Q07732	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	MDM38	Q08179	573 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	HIS5	P07172	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	SRP101	P32916	621 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	SLI1	P53304	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	YGR012W	P53206	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	CWC24	P53769	259 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJL007C	YJL007C	DCG1	P32460	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
YJL007C	YJL007C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	GIC1	P38785	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	SRT1	Q03175	343 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	CDA1	Q06702	301 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	NPP2	P39997	493 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	AIM21	P40563	679 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	MAD1	P40957	749 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	SFB2	P53953	876 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	MSS4	P38994	779 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	CHA4	P43634	648 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	KIN4	Q01919	800 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	SPE1	P08432	466 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	PRI2	P20457	528 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	HSF1	P10961	833 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	FUN30	P31380	1131 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	CCC2	P38995	1004 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJL007C	YJL007C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

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