RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592826.1

APBA3-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-208	ENST00000592826	PHF14	O94880	888 aa		29.49	■■■□□ 2.31
APBA3-208	ENST00000592826	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		29.49	■■■□□ 2.31
APBA3-208	ENST00000592826	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	29.48	■■■□□ 2.31
APBA3-208	ENST00000592826	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	29.47	■■■□□ 2.31
APBA3-208	ENST00000592826	APAF1	O14727	1248 aa		29.46	■■■□□ 2.31
APBA3-208	ENST00000592826	KCNQ3	O43525	872 aa		29.46	■■■□□ 2.31
APBA3-208	ENST00000592826	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	29.46	■■■□□ 2.31
APBA3-208	ENST00000592826	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		29.46	■■■□□ 2.31
APBA3-208	ENST00000592826	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	29.46	■■■□□ 2.31
APBA3-208	ENST00000592826	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		29.46	■■■□□ 2.31
APBA3-208	ENST00000592826	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	29.44	■■■□□ 2.3
APBA3-208	ENST00000592826	RFC4	P35249	363 aa		29.43	■■■□□ 2.3
APBA3-208	ENST00000592826	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	29.43	■■■□□ 2.3
APBA3-208	ENST00000592826	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	29.43	■■■□□ 2.3
APBA3-208	ENST00000592826	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		29.43	■■■□□ 2.3
APBA3-208	ENST00000592826	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	29.43	■■■□□ 2.3
APBA3-208	ENST00000592826	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	29.41	■■■□□ 2.3
APBA3-208	ENST00000592826	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	29.41	■■■□□ 2.3
APBA3-208	ENST00000592826	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		29.41	■■■□□ 2.3
APBA3-208	ENST00000592826	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		29.39	■■■□□ 2.3
APBA3-208	ENST00000592826	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	29.39	■■■□□ 2.3
APBA3-208	ENST00000592826	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	29.38	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	SMIM5	Q71RC9	77 aa		29.38	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		29.38	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		29.38	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		29.38	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826		A0A087WZG4	1122 aa		29.37	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	CCDC27	Q2M243	656 aa		29.37	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	CCER2	I3L3R5	266 aa		29.36	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	CHL1	O00533	1208 aa		29.36	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	GRIN3B	O60391	1043 aa		29.36	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	USP16	Q9Y5T5	823 aa		29.36	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	29.35	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	29.35	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	C1QTNF8	P60827	252 aa		29.35	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	CFAP44	Q96MT7	982 aa		29.35	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	ZPR1	O75312	459 aa		29.34	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	MSL1	Q68DK7	614 aa		29.33	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		29.33	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	NGEF	Q8N5V2	710 aa		29.33	■■■□□ 2.29
APBA3-208	ENST00000592826	COL15A1	P39059	1388 aa		29.32	■■■□□ 2.28
APBA3-208	ENST00000592826	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
APBA3-208	ENST00000592826	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
APBA3-208	ENST00000592826	A1BG	P04217	495 aa		29.31	■■■□□ 2.28
APBA3-208	ENST00000592826	GYS1	P13807	737 aa		29.31	■■■□□ 2.28
APBA3-208	ENST00000592826	NARF	Q9UHQ1	456 aa		29.31	■■■□□ 2.28
APBA3-208	ENST00000592826	GNAI1	P63096	354 aa		29.3	■■■□□ 2.28
APBA3-208	ENST00000592826	IFT57	Q9NWB7	429 aa		29.3	■■■□□ 2.28
APBA3-208	ENST00000592826	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	29.3	■■■□□ 2.28
APBA3-208	ENST00000592826	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		29.3	■■■□□ 2.28
APBA3-208	ENST00000592826	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		29.29	■■■□□ 2.28
APBA3-208	ENST00000592826	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		29.28	■■■□□ 2.28
APBA3-208	ENST00000592826	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	29.28	■■■□□ 2.28
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF853	P0CG23	659 aa		29.27	■■■□□ 2.28
APBA3-208	ENST00000592826	C4A	P0C0L4	1744 aa		29.27	■■■□□ 2.28
APBA3-208	ENST00000592826	WWC1	Q8IX03	1113 aa		29.26	■■■□□ 2.27
APBA3-208	ENST00000592826	ERBB4	Q15303	1308 aa		29.25	■■■□□ 2.27
APBA3-208	ENST00000592826	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
APBA3-208	ENST00000592826	MMP10	P09238	476 aa		29.24	■■■□□ 2.27
APBA3-208	ENST00000592826	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		29.24	■■■□□ 2.27
APBA3-208	ENST00000592826	HOXB7	P09629	217 aa		29.23	■■■□□ 2.27
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
APBA3-208	ENST00000592826	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		29.23	■■■□□ 2.27
APBA3-208	ENST00000592826	IL16	Q14005	1332 aa		29.22	■■■□□ 2.27
APBA3-208	ENST00000592826	RGL2	O15211	777 aa		29.22	■■■□□ 2.27
APBA3-208	ENST00000592826	MBIP	Q9NS73	344 aa		29.22	■■■□□ 2.27
APBA3-208	ENST00000592826	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		29.22	■■■□□ 2.27
APBA3-208	ENST00000592826	FKBP8	Q14318	412 aa		29.21	■■■□□ 2.27
APBA3-208	ENST00000592826	NBPF26	B4DH59	902 aa		29.2	■■■□□ 2.26
APBA3-208	ENST00000592826	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
APBA3-208	ENST00000592826	WDR63	Q8IWG1	891 aa		29.2	■■■□□ 2.26
APBA3-208	ENST00000592826	NBPF15	Q8N660	670 aa		29.2	■■■□□ 2.26
APBA3-208	ENST00000592826	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
APBA3-208	ENST00000592826	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		29.19	■■■□□ 2.26
APBA3-208	ENST00000592826	TM4SF1	P30408	202 aa		29.18	■■■□□ 2.26
APBA3-208	ENST00000592826	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		29.18	■■■□□ 2.26
APBA3-208	ENST00000592826	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		29.17	■■■□□ 2.26
APBA3-208	ENST00000592826	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
APBA3-208	ENST00000592826	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		29.16	■■■□□ 2.26
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		29.16	■■■□□ 2.26
APBA3-208	ENST00000592826	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
APBA3-208	ENST00000592826	CAMTA2	O94983	1202 aa		29.14	■■■□□ 2.26
APBA3-208	ENST00000592826	NFIX	Q14938	502 aa		29.12	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		29.12	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		29.11	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	ATP10D	Q9P241	1426 aa		29.11	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	MYL6B	P14649	208 aa		29.1	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	KRT24	Q2M2I5	525 aa		29.1	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		29.1	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		29.1	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	MIER1	Q8N108	512 aa		29.1	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	SCN7A	Q01118	1682 aa		29.09	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	TGFB2	P61812	414 aa		29.09	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	DDR1	Q08345	913 aa		29.09	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	PDIA6	Q15084	440 aa		29.09	■■■□□ 2.25

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