RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GIPC1-210ENST00000589497 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.84■■□□□ 1.57
GIPC1-210ENST00000589497 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GIPC1-210ENST00000589497 TJP1Q07157 1748 aa24.83■■□□□ 1.57
GIPC1-210ENST00000589497 MMP10P09238 476 aa24.83■■□□□ 1.57
GIPC1-210ENST00000589497 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
GIPC1-210ENST00000589497 GYS1P13807 737 aa24.82■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 A0A087WZG4 1122 aa24.81■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.8■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.8■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 GPR162Q16538 588 aa24.79■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.79■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.79■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.78■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 A1BGP04217 495 aa24.78■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 MRS2Q9HD23 443 aa24.78■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.78■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 USP16Q9Y5T5 823 aa24.78■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.78■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 COL15A1P39059 1388 aa24.78■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 NARFQ9UHQ1 456 aa24.77■■□□□ 1.56
GIPC1-210ENST00000589497 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
GIPC1-210ENST00000589497 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.76■■□□□ 1.55
GIPC1-210ENST00000589497 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-210ENST00000589497 FKBP8Q14318 412 aa24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-210ENST00000589497 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-210ENST00000589497 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.74■■□□□ 1.55
GIPC1-210ENST00000589497 APAF1O14727 1248 aa24.73■■□□□ 1.55
GIPC1-210ENST00000589497 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC184Q52MB2 194 aa24.73■■□□□ 1.55
GIPC1-210ENST00000589497 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.73■■□□□ 1.55
GIPC1-210ENST00000589497 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.72■■□□□ 1.55
GIPC1-210ENST00000589497 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.7■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.68■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 C4AP0C0L4 1744 aa24.68■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 TM4SF1P30408 202 aa24.67■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 TGFB2P61812 414 aa24.66■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 NFIXQ14938 502 aa24.66■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 DDR1Q08345 913 aa24.65■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 NGEFQ8N5V2 710 aa24.65■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 GRIN3BO60391 1043 aa24.64■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.64■■□□□ 1.54
GIPC1-210ENST00000589497 CHL1O00533 1208 aa24.63■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 NPHP1O15259 732 aa24.63■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 YY1P25490 414 aa24.63■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.63■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.63■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 NBPF26B4DH59 902 aa24.62■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 SERPINB2P05120 415 aa24.62■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 MYL6BP14649 208 aa24.62■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 NBPF15Q8N660 670 aa24.62■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 CFAP44Q96MT7 982 aa24.62■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 SETDB2Q96T68 719 aa24.62■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.62■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 A0A0G2JLW4 131 aa24.61■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 CAMTA2O94983 1202 aa24.61■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.61■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.6■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 GNAI1P63096 354 aa24.59■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.59■■□□□ 1.53
GIPC1-210ENST00000589497 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.58■■□□□ 1.53
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GIPC1-210ENST00000589497 DPEP1P16444 411 aa24.57■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 NECTIN2Q92692 538 aa24.57■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 IFT57Q9NWB7 429 aa24.57■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.57■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 ERBB4Q15303 1308 aa24.57■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 MBIPQ9NS73 344 aa24.55■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 BCS1LQ9Y276 419 aa24.55■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 PIM2Q9P1W9 311 aa24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 RGL2O15211 777 aa24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 ST5P78524 1137 aa24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC27Q2M243 656 aa24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 KRT24Q2M2I5 525 aa24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 CNBD1Q8NA66 436 aa24.52■■□□□ 1.52
GIPC1-210ENST00000589497 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.51■■□□□ 1.51
GIPC1-210ENST00000589497 HOXB7P09629 217 aa24.51■■□□□ 1.51
GIPC1-210ENST00000589497 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.51■■□□□ 1.51
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